DSP，MHC I类抗原呈递，原位RNA和蛋白质定位

MHC I类抗原呈递
LabEx（https://www.u-labex.com/）提供以下Luminex外包检测服务
近年来，随着生物技术和分析方法的不断进步，定量蛋白质和基因水平的研究在理解疾病机制和寻找治疗靶点等领域扮演着至关重要的角色。此外，深入了解组织生物学也需要考虑到空间维度的因素，因此空间分析在该领域的发展备受关注。Nature Methods杂志将空间多组学技术列为2022年最令人期待的七项技术之一，目前已有多家企业推出了空间多组学技术的商业化产品，有助于研究人员探索空间转录组的奥秘。

Nanostring GeoMx DSP技术提供结合了组织影像分析技术和高通量分子定量技术，能够在组织切片原位实现多靶标蛋白和全转录组的空间原位表达谱分析。通过捕获具有形态学背景的图像，按照组织形态、表型、单个细胞、按网格或者绘制区域轮廓，研究者可以选择感兴趣的区域进行分析。

DSP Workflow全流程

1、标记荧光抗体与待测指标共孵育：一张5μm厚度的切片同时用成像试剂（荧光标记的抗体/探针）和定量试剂（Oligo标记抗体/探针）混合杂交

2、ROI区域圈选：可以选择任何区域，任何形状和大小的ROI

3、区域划分&紫外光解DSP Barcode：每个圈选的目标区域依次被紫外光照射，并切断定量试剂上偶联的Oligo序列。在不接触样本的情况下，用微毛细管快速吸出解离的Oligo序列，使样本切片完整。

4、逐个ROI收集DSP Barcode到96孔板： Oligo标签被收集到96孔收集板中，每一个孔对应组织切片上选择的一个ROI/AOI。

5、Barcode计算、测序和数据分析：收集的Oligo利用高通量测序（NGS）或 在NanoString的nCounter平台上进行定量。

样本类型

 穿刺样品、FFPE石蜡包埋样品、组织阵列样品（TMA）、新鲜/冻存样品、固定切片

 

应用领域

• 1、肿瘤/肿瘤免疫：肿瘤异质性/分型、肿瘤耐药机制、肿瘤转移机制、肿瘤免疫微环境、免疫治疗、化疗预后标志物发现
• 2、免疫学/感染科学：感染组织原位免疫反应关系、治疗、预后靶点发现和验证、感染和组织损伤、肿瘤发生的关系、感染的分子病理图谱分析
• 3、神经科学：神经系统细胞群组织原位分布和相互作用机制、神经退行性疾病、神经系统肿瘤、神经系统感染
• 4、组织疾病：器官组织异质性、组织器官亚结构分析和疾病关系、组织疾病精细分子病理图谱
• 5、发育生物学：器官亚结构发育分子机制、发育类疾病相关的分子生物学通路的研究

 

技术优势

• 1、Proteins & RNAs 组织原位表达，从靶向蛋白到全转录组分析方案
• 2、兼容FFPE石蜡包埋样品，实现高靶点+高灵敏度分析
• 3、灵活、精准的区域(ROIs)选择和自动化富集细胞群
• 4、应对多种应用场景
• 5、预先验证的Panel&客制化方案

服务列表

服务类型	种属	Panel说明
空间蛋白检测	人，小鼠	使用NGS 平台在空间水平同时分析570+蛋白靶标.支持添加额外40个蛋白靶标涵盖77条功能通路.覆盖肿瘤研各个方面
应用领域	免疫调控/炎症、肿瘤/免疫研究、细胞功能研究、T细胞研究、信号通路研究等
人全转录组图谱(WTA)	人	人全转录组图谱覆盖人的全转录组，可以在在单个组织切片中同时分析 18,000 多个基因的 RNA 表达。
小鼠全转录组图谱（Mu WTA）	小鼠	小鼠全转录组图谱覆盖所有小鼠品系的全转录组，可以在在单个组织切片中同时分析21,000 多个基因的 RNA 表达。
癌症转录组图谱(CTA)	人	癌症转录组图谱用于对肿瘤生物学、肿瘤微环境和免疫反应进行全面分析，可以在在单个组织切片中同时分析 1,800 多个基因的RNA表达。
犬癌症图谱	犬	犬癌症图谱用于研究犬对癌症以及免疫生态学治疗的免疫反应,可以在单个组织切片中同时分析1,962多个基因的 RNA 表达。
空间多组学数据分析	不限	提供标准化及定制化数据分析，包括箱型图、散点图、火山图、条形图等多种展示

更多服务可见LabEx DSP空间多组学方案设计工具

LabEx空间蛋白检测服务

570+蛋白靶标,支持添加额外40个蛋白靶标涵盖77条功能通路.覆盖肿瘤研各个方面

 

结果展示

数据分析：提供多种数据视图，包括箱型图、散点图、火山图、条形图等

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上海乐备实生物技术有限公司，简称乐备实(LabEx)，是上海优宁维生物科技股份有限公司旗下全资子公司，主要专注于提供多组学/多因子相关检测分析的实验服务专家，目前已扩展到单细胞测序、空间多组学、流式检测、电化学发光、液相微阵列、蛋白芯片、抗体芯片、PCR Array、ELISA、Elispot、多色免疫组化等30+个技术平台。已经为超过3000个客户提供服务，累计检测样本超过100万，受到了广大客户的赞赏。