转录组测序

转录组（Transcriptome）是指一个活细胞所能转录出来的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。转录组学（Transcriptomics）是使用高通量测序技术，全面快速获取某一物种特定组织或器官在某一状态下RNA序列信息，并对其结构和表达信息进行分析。可用于预测基因结构、可变剪切和其他转录修饰，并可定量测定每个转录本在生长过程中和不同条件下表达水平的变化。

（Schematics of RNA-Seq workflow. Wang Y et al., Bioinformatics. 2011）

麦特绘谱可提供的技术服务：

1）真核有参转录组测序

真核生物转录组测序可以分为有参和无参的情况。真核有参转录组测序，指对已有参考基因组的真核生物或其组织、细胞等进行转录组测序。通过与参考基因组比对，可验证转录组测序的测序饱和度和基因覆盖度，同时可获得基因结构、基因表达差异，和可变剪接等信息。

2）真核无参转录组测序

真核生物转录组测序可以分为有参和无参的情况。真核无参转录组测序，指在无参考基因组的情况下,对真核生物转录组进行测序。真核无参转录组测序在获得原始数据后,首先要进行质控拼接为unigene，再以unigene为参考序列进行后续分析,包括功能注释、SNP、SSR标记开发等。也可以对多个样本进行差异基因表达分析和差异基因功能富集分析等,用于发现功能基因,为下一步研究提供方向。

3）原核转录组测序

原核转录组测序可以从基因表达量、基因结构和sRNA调控功能三维度揭示不同生物性状的分子调控机制。如通过计算各组间的差异基因并对差异基因进行富集分析，获得对生物性状影响较大的通路信息；通过预测基因的反义转录本，丰富基因组注释内容；研究sRNA对mRNA的相互作用，从分子调控角度解释生物性状之间的差异。

4）全转录组测序

全转录组即特定细胞或组织在某一功能状态下转录产物 (mRNA、 LncRNA、 CircRNA 以及 microRNA) 的合集。全转录组测序可对同一个样品同时进行 mRNA、 LncRNA、 CircRNA 和 microRNA 的单独分析，还可进行多种 RNA联合分析以及内源竞争性 RNA 整合分析，分子标记筛选等，探究其潜在的调控网络机制，揭示转录调控问题。主要应用于免疫机制、疾病领域、发育进化、致病机理和药物靶标等方面的研究。

5）三代全长转录组测序

基于三代测序平台的全长转录组测序，可直接获取mRNA全长序列，更为准确地解读mRNA结构信息，重点关注基因的可变剪切、融合基因等。应用领域：获得基因组未知物种的基因集，用于基因功能研究；基因结构差异分析；发现新转录本；分子机制研究；基因表达调控研究等。

样本量推荐：

组织：200 mg

细胞：10E6

细菌：湿重0.2g

麦特绘谱生物科技（上海）有限公司（Metabo-Profile）依托香港浸会大学贾伟教授课题组汇聚了从事代谢组学和转化医学研究近二十年经验的海内外科研专家团队，专注于精准医学和健康领域的高端代谢组学技术服务及科研、临床检测试剂盒产品研发。业务覆盖临床、药物、动物和微生物、细胞、食品及环境等领域，是一家集科技服务、健康检测及产品研发为一体的高新技术企业，已成为代谢组学研究者的优选合作伙伴。

公司拥有自建的1500+功能性小分子代谢物数据库JiaLib™、国际前沿的代谢组学分析技术平台和全自动化数据处理软件、代谢组学数据在线分析平台以及自主知识产权的体外诊断试剂盒、智能辅助软件及功能食品等，目前已取得 55 项自主研发专利及软件著作权，获批临床注册证产品 21 个。成立至今，麦特绘谱已为数百家三甲医院、科研院所和企业提供高端、定制化的代谢组学一站式整体解决方案，协助客户与合作伙伴发表SCI文章百余篇，累积影响因子600+，包括Cell Metabolism、Immunity、Gut、Hepatology、Microbiome、Nature Communications等顶级期刊。

麦特绘谱一直致力于代谢组学前沿技术方法及临床应用产品转化，将传统非靶向代谢组技术全面升级至可标准化的绝对定量方法，成功开发出业界具有影响力的代谢组学产品——Q300 全定量代谢芯片试剂盒，已成为全球代谢组学分析的优选工具。目前Q300试剂盒已被应用于检测多个疾病大队列人群数据，针对中国人群构建起健康-疾病代谢数据库，开展基于代谢组学的精准医疗和大健康产业相关产品服务，逐步实现临床转化，为推动个体化精准医疗服务提供标准化技术支持。


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