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这一项研究将调控机制研究延伸到“ 网、多层面”结合的立体模式,有助于相对全面解读生物学现象。
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推荐方案
推荐两种测序策略方案:
1) 经济型模式-两种文库测序:LncRNA-Seq + Small RNA
大RNA研究:采用LncRNA-Seq测序模式,即采用去核糖体链特异性建库模式,进行PE100测序模式,10G Clean data;实现lncRNA、mRNA、circRNA鉴定和定量、以及功能分析;
小RNA研究:采用富集小RNA片段建库方法,进行有方向性的SE50测序模式,20M clean reads,实现miRNA、siRNA以及piRNA鉴定和定量,以及功能分析等;
2) 大容量模式-三种文库测序:LncRNA-Seq+ Small RNA+ CircRNA
大RNA研究:采用LncRNA-Seq测序模式,即采用去核糖体链特异性建库模式,进行PE100测序模式,10G Clean data;实现lncRNA、mRNA、鉴定和定量、以及功能分析;
环状RNA研究:采用去除线性RNA,反向富集环状RNA建库方法,进行PE100测序模式,10G clean data,对环状RNA高深度测序,实现对低丰度的环状RNA鉴定和定量及功能分析;
小RNA研究:采用富集小RNA片段建库方法,进行有方向性的SE50测序模式,20M clean reads,实现miRNA、siRNA以及piRNA鉴定和定量,以及功能分析等;
以上两种模式,还可以实现大RNA和小RNA互作网络分析,以及内源竞争性RNA鉴定和网络分析。
生物分析思路图
产品优势
实验严谨
建库工艺稳定,技术重复性高,可接受多种类型样本,total RNA最低起始量低至400ng;
分析全面
包含RNA互作模式,及ceRNA竞争网络分析等,从平面调控研究延伸至立体调控研究;
数据交互
采用Dr.Tom多组学数据挖掘系统,10大数据库注释,多维度结果图片展示,数据图表循环挖掘;
质控严格
实验操作及信息分析操作采用全方位及先进的质量管理体系标准。
产品应用
动植物生长发育的研究
抗逆、抗病虫害调控机理的研究
细胞分化和发育的研究
肿瘤发生发展及转移研究