UMI Small RNA 测序

UMI Small RNA测序，文库构建时引入特异性分子标签（UMI），结合高通量测序，研究某物种某组织在特定时空状态下18-30 nt的small RNA片段序列信息，实现精准定量，通过与数据库比对, 可实现small RNA序列的鉴定、靶基因分析和功能分析， 以及包含miRNA、siRNA、piRNA等多种small RNA类型的分析研究需求等。主要应用在动植物生长发育调控研究、抗病抗逆调控研究、生物性状及突变调控研究等；在疾病研究方面，可研究疾病发生调控机制、寻找生物标记、靶向药物研究等。

技术优势

1.  实验方法升级，数据库更新，sRNA定量结果更可靠

建库引入UMI技术，实现无偏向的精确定量，矫正原有70%的reads定量偏差；采用权威miRBase数据库、KEGG数据库；

2.  实验技术经验丰富，低起始量成功率高，技术重复性高

已完成350多种不同物种的项目，常规样本单次建库只需100ng，血清血浆样本只需20ng；小RNA样本实现最低1 ng起始量；低起始量建库成功率达95%；建库、测序技术重复性高；

3.  多样的样品类型，满足多角度研究需求

接收除常规样品以外的血清、血浆样品、组织液样品、FFPE样品、外泌体、RIP富集RNA等多种类型；

4.  Dr.Tom系统交付，多种个性化分析任您选

采用Dr.Tom多组学数据挖掘系统，10大数据库注释，多维度结果图片展示，数据图表循环挖掘；

5.  无忧解决售后

可根据客户需求进行贴身个性化服务，为文章撰写提供技术服务。

研究内容
利用DNBSEQ平台，对富集到的18-30nt的小RNA片段进行测序，对获得的有效数据进行序列长度分布统计，将筛选后的高质量序列分类注释，从而获得样品中包含的各组分及表达量信息，并对所有小RNA片段进行注释，对miRNA进行靶基因预测等分析。

标准信息分析

1.  数据产出统计，对原始信息采集数据去接头污染，去低质量reads

2.  small RNA 信息采集结果的长度分布

3.  small RNA在选定的参考基因组上的分布

4.  small RNA分类统计

5.  miRNA定量分析

6.  miRNA差异表达分析

7.  miRNA表达/差异表达聚类分析

8.  miRNA靶基因分析

9.  差异miRNA 靶基因GO 注释和KEGG 通路分析

高级信息分析

一）数据库注释

1. 转录因子注释（AnimalTFDB/PlantTFDB）

2. GSEA分析

3. Rfam、Pfam、Reactome、COG、EggNOG和InterPro数据库注释

二）互作网络分析

1. 靶基因分析

① miRNA-mRNA靶向关系分析

② lncRNA-mRNA靶向关系分析

2. ceRNA互作网络分析

3. 蛋白互作网络分析

4. 共表达互作网络分析

三）特色分析

1. 外部数据库关联分析（TCGA、ARCHS4）

2. 关键驱动基因网络图分析

华大科技于2012年完成整合，致力于成为全球生命科学研究机构的首选科技服务商，为从事生命科学研究的机构和企业提供高质量、行业领先的基因测序、质谱、合成生物学、生物数据库、云计算等标准化的技术服务和综合的全流程解决方案。 目前，公司服务已经覆盖了全球100多个国家和地区，拥有7,000多位合作单位，为25,000多位行业联系人提供了杰出技术支撑与服务，更通过深度合作完成了一系列大型基因组科研计划和国际多边合作项目。科研积累上，截至2020年9月底，公司累计参与发表近1,500篇文章，其中CNNS 120+。截止2022年3月，华大自主测序平台DNBSEQTM 助力发表2,013+篇高质量文章，影响因子合计8,800+，并实现CNS三大主刊发文。