RNA-Seq

RNA-Seq，对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序，可以提供定量分析，检测基因表达水平差异。

技术优势

数字化信号：测序直接获得序列，无背景噪音，无交叉杂交；可鉴别序列间单个碱基的差异；

高通量：一次测序得到千万条以上的序列；

检测阈值宽：跨越6个数量级的宽检测阈值，从几个到数十万个拷贝精确计数；

良好的重复性：深度测序保证了抽样随机性，重复性非常好，无需重复实验；

高灵活性 ：依据客户需求，提供不同测序平台服务。

 

产品应用

医学上的应用方向——

 

农学上的应用方向 ——

研究内容

标准信息分析：

1. 基本数据统计① 去除接头序列、低质量序列得到reads信息，② 样品相关性，③ 表达量分布，④ RNA分类；

2. 参考基因组比对；

3. mRNA鉴定；

4. mRNA定量分析；

5. mRNA差异表达分析（样本间、组间）；

6. mRNA表达/差异基因聚类；

7. mRNA差异基因GO分类、富集；

8. mRNA差异基因KEGG分类、富集。

Dr.Tom信息分析：

一）数据库注释

1. 转录因子注释（AnimalTFDB/PlantTFDB）；

2. GSEA分析；

3. Rfam、Pfam、Reactome、COG、EggNOG和InterPro数据库注释；

二）互作网络分析

1. 靶基因分析① miRNA-mRNA靶向关系分析，② lncRNA-mRNA靶向关系分析；

2. ceRNA互作网络分析；

3. 蛋白互作网络分析；

4. 共表达互作网络分析；

三）特色分析

1. 自定义标签和自有数据上传；

2. 外部数据库信息（TCGA、ARCHS4）；

3. 关键驱动基因网络图分析；

4. 时间序列分析。

（*以上分析内容为部分物种可做。）

定制化信息分析：

1. 可结合客户的需求，协商确定定制化信息分析内容。

华大科技于2012年完成整合，致力于成为全球生命科学研究机构的首选科技服务商，为从事生命科学研究的机构和企业提供高质量、行业领先的基因测序、质谱、合成生物学、生物数据库、云计算等标准化的技术服务和综合的全流程解决方案。 目前，公司服务已经覆盖了全球100多个国家和地区，拥有7,000多位合作单位，为25,000多位行业联系人提供了杰出技术支撑与服务，更通过深度合作完成了一系列大型基因组科研计划和国际多边合作项目。科研积累上，截至2020年9月底，公司累计参与发表近1,500篇文章，其中CNNS 120+。截止2022年3月，华大自主测序平台DNBSEQTM 助力发表2,013+篇高质量文章，影响因子合计8,800+，并实现CNS三大主刊发文。