环状DNA（eccDNA）测序

eccDNA测序简介

染色体外环状DNA（extrachromosomal circular DNA，eccDNA）广泛存在于真核生物细胞中，它们游离于染色体基因组之外，由基因组分离或脱落形成。eccDNA长度从几十bp到几十万bp。人们发现肿瘤细胞中存在大量eccDNA，且携带原癌基因，可以通过增加癌基因的表达促进肿瘤发生。此外，eccDNA还与耐药、衰老、肿瘤异质性、细胞间交流等功能相关。eccDNA已经成为生命科学领域新的研究热点。
eccDNA测序结合环状DNA富集，滚环扩增和高通量测序技术检测并定量样品中的eccDNA，为eccDNA在疾病中的功能研究奠定基础。

送样指南

细胞：2x10⁷
组织：200 mg
全血：5 mL
血清、血浆：10 mL

结果展示

经典案例

1. Sin STK, Jiang P, Deng J, Ji L, Cheng SH, Dutta A, Leung TY, Chan KCA, Chiu RWK, Lo YMD. Identification and characterization of extrachromosomal circular DNA in maternal plasma. Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 Jan 21;117(3):1658-1665
2. Yang H, He J, Huang S, Yang H, Yi Q, Tao Y, Chen M, Zhang X, Qi H. Identification and Characterization of Extrachromosomal Circular DNA in Human Placentas With Fetal Growth Restriction. Front Immunol. 2021 Dec 21;12:780779
3. Wei Xiang, Tongyi Zhang, Song Li, Yunquan Gong, Xiaoqing Luo, Jing Yuan, Yaran Wu, Xiaojing Yan, Yan Xiong, Jiqin Lian, Guangyu Zhao, Changyue Gao, Liang Kuang, Zhenhong Ni. cir-DNA sequencing revealed the landscape of extrachromosomal circular DNA in articular cartilage and the potential roles in osteoarthritis. bioRxiv 2022.01.27.477985

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