转录组测序

有参考基因组的转录组测序

    转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和。转录组测序能够从整体水平研究基因功能以及基因结构，揭示特定生物学过程中的分子机理；目前已广泛应用于基础研究、临床诊断、药物研发和分子育种等领域。

    有参转录组测序目标：

        1. 获得全面转录本信息；

        2. 检测稀有转录本和发现新的转录本；

        3. 精确识别可变剪切位点，以及不同转录本之间的单碱基差异。

    一、技术流程

    二、生物信息分析内容

        1. 测序质量分析与统计、评估；

        2. 参考基因组比对；

        3. 新转录本预测；

        4. 基因表达定量分析、基因表达水平分析；

        5. 差异基因表达分析、差异表达基因GO富集分析和Pathway富集分析；

        6. SNP和Indel分析；

        7. 可变剪切分析；

        8. DEU分析。

    三、结果展示

        1.数据库使用

        2.版图展示

        如图1.1所示，符合差异表达条件的基因在图上以蓝色圆点表示；

图1.1 火山图

    四、样本要求

        总量：〉4 µg RNA；浓度：〉50 ng/µL；260/280：〉2.0

广州贯善生物科技有限公司，2012年成立于广州，是一家以核酸和蛋白技术为核心，专注于产品研发、销售和技术服务的生物科技企业。

贯善生物在高通量测序、蛋白质组学、分子生物学、细胞生物学以及免疫学等研究领域拥有多年的丰富经验。全面的技术服务，基本囊括了现有生命科学研究的主要领域，已成为全球诸多知名跨国公司和著名高等学府的战略合作伙伴和首选供应商。贯善生物自主研发的SATXAM系列产品和技术服务已被国内外2000多家公司广泛使用，在中国生命科学市场的占有率名列前茅。