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数字表达谱分析;DGE测序;表达谱分析
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技术简介
数字基因表达谱(DGE)是研究某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况,能够全面、经济、快速地检测不同材料间的差异表达基因。
技术路线图

生物信息分析

常规分析:
1.测序数据质控分析
2.库容量饱和度分析
3.高质量序列与参考基因组比对
4.全基因组序列(reads)分布图谱
5.基因表达量统计分析
6.样品可重复性分析
高级分析:
7.样本间差异表达基因分析
8.差异表达基因GO功能富集分析
9.差异表达基因KEGG富集分析
10.蛋白网络构建及分析
个性化分析:
11.根据客户需求进行个性化定制分析
案例解析
基因表达分析
基因表达量的非监督层次聚类分析表明CHB病人和HBC病人群体之间的基因表达量具有显著性差异。

测序策略及数据量
测序策略:SE50
建议数据量:一般测序:10M clean reads
深度测序:20M clean reads