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长链非编码RNA测序

长链非编码RNA测序


lnc RNA-seq, long non-coding RNA-seq
长链非编码RNA长度大于200bp,在剂量补偿效应、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用,是近期遗传学研究热点。
服务类别:测序/合成总访问:628
最后更新:2015-3-4半年访问:64
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服务商: 上海绿宇生物科技有限公司 查看该公司所有服务 >>
  • 服务介绍
  • 公司简介

绿宇优势

1. 熟悉绝大多数组织的RNA抽提及纯化方法,解除您的RNA抽提纯化之忧。

2. 采用有方向性测序,拒绝无意链测序数据浪费及干扰。

3. rRNA去除效率高, 拒绝无效rRNA测序数据浪费及干扰。

4. 权威专家远程指导数据分析,可根据您的分析要求,突现您成果的闪光点。

5. 专业的实验操作团队,确保在文库的构建过程的RNA最小的降解、DNA最小的损耗。确保测序结果与样品本身的高度一致性。

6. 测序结果可由国际知名专家为您进行生物信息学分析,提供可用于发表SCI论文所需的数据和图表素材。

7. 测序周期短,加急测序可三周出数据,加速您的科研进程。

8. 样品起始量要求低,最低10ng total RNA即可进行有效测序。

9. 测序质量高,测序服务好,测序周期短,最快一个月可出测序结果。

基本路线

抽提RNA

↓

基因组去除

↓

rRNA去除

↓

RNA片断化

↓

两端加接头

↓

反转录

↓

PCR扩增

↓

选择一定大小的cDNA

↓

文库质检

↓

上机测序

↓

生物信息学分析

项目周期

视项目方案而定,一般在40工作日左右

测序方式

1: 测序平台:Hiseq 2500, PE2*125

生物信息服务

1. 标准化分析

  • 1) 数据清理
  • 2) 转录本组装
  • 3) 鉴定已知转录本(包括已知lncRNA)和新转录本
  • 4) 预测新的lncRNA
  • 5) 表达量的差异分析(样本数>2)
  • 6) 表达差异基因的聚类分析(样本数>2)

2. 高级分析

  • 1) 功能预测
  • 2) 靶基因预测
  • 3) 靶基因GO,KEGG富集分析
  • 4) 送样时使用干冰运输(不超过72h)。
  • 5) 客户需要的其它个性化分析

送样要求

1. 组织样品(动植物或微生物)

  • 1) 总量大于2g的新鲜样品;植物材料应尽量选取幼嫩部位,避免过老的组织。
  • 2) 样本采集立即用液氮速冻,保存于-80℃(保存期不超过1个月),送样时使用干冰运输(不超过72h)。
  • 3) 送样管务必标清样品编号,管口使用Parafilm膜密封。
  • 4) 样品保存期间切忌反复冻融。
  • 5) 样品质量合格与否的判断标准:RNA提取后经变性电泳,各RNA条带清晰,比例适中,完整性好,无降解。

2. RNA样品

  • 1) 请提供OD260/280介于1.8~2.2之间,浓度≥250ng/μl,总量≥20μg的总RNA,并确保RNA无降解,无污染;或提供浓度≥50ng/μl,总量≥400ng的mRNA。
  • 2) 送样管务必标清样品编号,管口使用Parafilm膜密封。
  • 3) 样品保存期间切忌反复冻融。
  • 4) 送样时使用干冰运输(不超过72h)。
  • 5) 质检以我方电泳胶图、紫外分析仪定量为准。
  • 6) 送样时附带提供RNA电泳检测照片。
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