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PeakTrace数据分析服务
PeakTrace DNA数据分析服务
服务类别:分析测试总访问:1823
最后更新:2019-5-11半年访问:65
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 PeakTrace DNA数据分析系统能从 ABI KB Basecaller 分析的 ab1文件中提取出原始数据,通过一系列算法从头处理,能提高测序读长,减少错误,提高通量。

良好的兼容性
PeakTrace/Lontrace DNA 序列分析系统适用于 ABI 377 , 310 , 3700 , 3730 , 3730xl , 3100 和3130, Megabase和Beckman系统 
 
 
操作方便
   直接将 KB Basecaller 分析的 trace( 扩展名为 abi 或 ab1 的文件 ) 导入 PeakTrace DNA 序列分析系统,经过短时间处理,系统将自动生成与处理前的 trace 同名的文件,并存入预先指定的文件夹中。
 
 
提高读长,减少错误
     PeakTrace DNA序列分析系统从ABI KB Basecaller分析的trace中提取出原始数据,通过一系列算法从头处理,能提高可信的测序读长,减少错误,提高仪器通量。   
 
 
 
comparison of PeakTrace basecalling with ABI KB basecalling
, ABI KB Basecaller 和PeakTrace分析结果的比较
 
 
常见问题
 
很多数据读长超过800bp之后,分辨率比较低,经过  PeakTrace系统重新分析后,能将读长增加0-200bp ,使读长达到甚至超过 1000bp ,并提高分辨率。那么增加的读长部分,比如 800 - 1000bp 的部分,从分析后的峰图上看起来很准确,实际上这些数据可信吗?
 
   经过PeakTrace/Lontrace重新分析的数据,可信度都是用 Qscore 来评价,可以在系统中进行设置,默认条件下是 20 ,即进行 basecalling 的错误概率低于 1 %;如果要求更高,可以设置成为 30 ,则进行 basecalling 的错误概率低于 0.1 。
   通过实验也能进行验证,比如用序列拼接或者对 DNA 片断进行反向测序,用实验数据和系统重新处理的结果进行比较即可。
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