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实验技术服务
SSR引物开发及检测、AFLP检测群体遗传多样性检测;MSAP、BSP甲基化分析;SNP等个体化分型检测项目;条形码分析(核基因组ITS,叶绿体基因,线粒体测序);荧光定量分析等。
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最后更新:2025-4-6半年访问:160
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服务商: 北京中生柏奥生物科技有限公司 查看该公司所有服务 >>
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  • 公司简介

中生柏奥技术服务项目
中生柏奥目前建立了一代测序平台和荧光定量等平台等。公司致力于: SSR引物开发及检测、AFLP检测群体遗传多样性检测;MSAP、BSP甲基化分析;SNP等个体化分型检测项目;条形码分析(核基因组ITS,叶绿体基因,线粒体测序);荧光定量分析(相对和绝对定量分析,标准品构建);群落结构分析(16SDNA文库,Miseq测序)等。

1、STR/SSR微卫星分析

微卫星位点通常通过PCR扩增和电泳检测,并根据片段大小分离等位基因进行分析;扩增后的等位微卫星可以用多种方法检测,1)传统方法采用聚丙烯酰胺凝胶电泳银染的方法适用于前期批量引物筛选;2)利用ABI遗传分析仪对荧光标记的DNA片段进行检测,结合分子量内标进行DNA片段长度计算,使STR分型变得快捷,适合大量样本的检测。

项目名称   项目 费用 备注
微卫星
       (STR/SSR分型)
SSR引物开发 利用磁珠富集法从未知物种里边开发 30,000元 开发出40条特异性引物,并进行测序胶引物验证;
SSR引物筛选 PCR扩增 8元/孔 96个以上优惠  
PAGE筛选 12-16元/孔 一板50个孔    
SSR批量试验 PCR扩增 5元/孔 96个以上优惠  
3730xl测序仪检测 8-12元/孔 96个样本一板,批量不足一板按一板计算;
       条带读取,统计分析另外收费
   

1) 提供服务内容

1 按照客户要求设计实验方案,包括是否需要引物筛选,荧光标记的选择,引物的设计、合成和标记;引物组合的确定;

2-1 按照设计的试验方案完成引物筛选;(如果已经选好跳过这一步)

2-2 完成荧光PCR,并在3730xl测序仪上完成数据采集;(前期会进行预实验)

3 对没有扩增出来的进行二次PCR,再次检测;

4 对收集的数据进行处理,提取结果图谱

5 可以去除影子带进行片段统计

6 标准分析: 根据毛细管电泳图谱,将检测峰判读为对应的等位基因;

高级分析:聚类分析;多样性分析;多态位点数(AP)、多态位点百分率( P)、平均等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei′s基因多样性指数(H)、Shannon′s信息指数(I)、遗传分化度(Gst)等。

2)目前已经进行的样本类型:树木,草,花卉,昆虫,鱼类,虾类,真菌等;

3)客户提供:

★ 基因组DNA:

●至少15μL样品,浓度为50-100ng/μL;

●2%琼脂糖电泳检测有DNA主带,没有降解;

●DNA经过DNA纯化试剂盒或磁珠纯化;

●DNA需溶解在TE或灭菌的去离子水里;

●DNA溶解后,肉眼看不到杂色;

★ 植物材料: 新鲜组织,叶片采用硅胶干燥后或干冰运输;

★ 动物材料: 新鲜组织,无水乙醇封存低温运输;

 

 

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