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宏基因组测序是对环境样品中的微生物群落的基因组进行高通量测序,主要研究微生物种群结构、基因功能活性、微生物之间的相互协作关系以及微生物与环境之间的关系。
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宏基因组研究策略的出现,使得我们无需分离培养单个微生物,利用高通量测序技术即可对来自特定环境或人体部位的微生物群落展开全局研究。16S rDNA因其序列在物种间的高度多样性,成为细菌分类学研究的“分子钟”,其序列包含可变区和保守区,可变区因细菌而异,且变异程度与细菌的系统发育密切相关。16S rDNA测序是通过提取微生物菌群的DNA,选择可变区的特定区段进行PCR扩增,再结合高通量测序分析,帮助研究人员大规模鉴定细菌群落组成,表达丰度,以及开展系统进化分析,促进了我们对微生物群落与环境互作,以及与人类互作的理解。




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