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Oligo DNA的人工化学合成始于50年代初期,1980年全自动的固相DNA合成仪面市后,使得快速、高效合成Oligo DNA成为可能,化学合成DNA已经成为分子生物学实验中最基础的试剂之一。
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现在一般都采用亚磷酰胺化学合成Oligo DNA片段,具有高效、快速偶联以及起始反应物比较稳定的特点。该方法是在固相载体上完成DNA链的合成的,合成时从3'→5'方向进行,通常3'端的第一个碱基结合在Glass担体(Controlled Pore Glass,CPG)上。Oligo DNA合成的原理基本相同,主要差别在于合成产率的高低、试剂消耗量和单个循环用时的不同。我公司采用的合成仪主要机型为ABI3900高通量合成仪。
合成的详细过程见图1,现简要说明如下:

图1 Oligo DNA合成原理图。N1代表第一个碱基,N2代表第二个碱基,依次类推。
第一步,三氯乙酸和预先连接在固相载体(CPG)上的第一个核苷酸反应(其活性基团处于被保护状态),脱去核苷酸5‘-羟基的保护基团DMT,获得游离的5‘-羟基;
第二步,活化新的碱基单体(Phosphoramidite),准备与第一个碱基进行反应;
第三步,合成DNA的原料(亚磷酰胺保护的核苷酸单体)与活化剂四氮唑混合,得到核苷亚磷酸活化中间体,它的3‘端被活化,5‘-羟基仍然被DMT保护,与溶液中游离的5‘-羟基发生缩合反应;
第四步,带帽(capping)反应,缩合反应中可能有极少数5‘-羟基没有参加反应(少于2%),用乙酸酐和1-甲基咪唑终止其后继续发生反应,这种短片段可以在纯化时分离掉;
第五步,在氧化剂碘的作用下,亚磷酰形式转变为更稳定的磷酸三酯。(即将三价磷氧化成五价磷) (重复进行Step1~Step5的循环,直至合成完所需的Oligo DNA序列)
第六步,合成结束后,将Oligo DNA分子从CPG上切下,再进行进一步的纯化。
合成过程中可以观察TCA处理阶段的颜色判定合成效率。连接在CPG上的引物被切下来,通过, PAGE等手段纯化引物,成品引物用C18浓缩、脱盐,测定OD260定量,根据定单要求分装。
我公司合成Oligo DNA制品有如下特点:
1 高质量合成。使用进口试剂,合成高质量的DNA制品。
2 高纯度纯化。推出脱盐纯化、PAGE纯化、HPLC纯化三种级别制品,客户可根据实验需要进行选择。我们保证对每个制品都进行严格的质量管理。
3 完善的数据。制品包装中附有制品相关的多种数据,包括:合成的原始数据,A、G、C、T各碱基的分布情况,分子量,OD数,nmol数等,使用方便。