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全基因组测序
利用第二代测序代表的454 Genome Sequencer焦磷酸测序技术进行全基因组的测序:原核生物全基因组;线粒体、叶绿体、病毒、质粒基因组;真核生物全基因组。

服务类别:测序/合成总访问:3511
最后更新:2010-12-20半年访问:61
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  • 公司简介

 

由于测序通量大、长度长、准确度高等优势,作为第二代测序代表的454 Genome Sequencer焦磷酸测序技术,从2005年开始,已经广泛地应用于全基因组的测序,主要有:
(1)原核生物全基因组;
(2)线粒体、叶绿体、病毒、质粒基因组;
(3)真核生物全基因组。
 
实验的技术路线:
 
(一)、原核生物以及线粒体、病毒等的全基因组测序
(1)从样品中提取基因组DNA;
(2)用物理方法将基因组DNA破碎成300-800bp的DNA片段;
(3)测序文库的制备以及后续的操作参考454 GS FLX系统的工作流程;
(4)测序后的组装以及基因预测、功能分析等生物信息分析。
 
(二)、真核生物全基因组测序
由于真核生物的基因组较大,重复序列较多,基因组结构较复杂,目前,测序的策略还是采用基于构建BAC等文库的基础上进行。也就是说,对BAC等文库进行测序。
(1)从样品中提取基因组DNA;
(2)构建基因组文库,如BAC等文库;
(3)针对BAC等文库进行454测序;
(4)进入454 GS FLX系统的工作流程;
(5)测序后的组装以及生物信息学分析。
 
 
 实验样品的要求:
 
纯化好的DNA片段〉1.5kb,浓度〉50ng/ul,总量在5-10ug,OD260/OD280的值在1.8-2.0。

实验服务的价格:

 基因组DNA大小(bp)  测序获得的数据量(bp) 草图的报价(元) 
  小于8M  180M-250M  11万
  8M-15M  350M-500M  18万
 大于15M  依客户要求而定  协商

实验服务的周期:

一般情况下在6-8周,具体的时间依客户需要完成的项目而定。

更多的需求,请进一步咨询。

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