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中科新生命推出完整N-糖肽蛋白质组学分析服务
点击次数:1310 发布日期:2022-7-22  来源:中科新生命


糖基化修饰是生物体内普遍发生的一种翻译后修饰,生物体内约50%的蛋白均可发生糖基化,在很多生命过程和疾病中发挥着非常重要的作用。目前许多疾病诊断的标志物及治疗的靶标也都是糖蛋白。

糖蛋白中的蛋白质是生理功能的主要承担者,而糖链则影响着蛋白质的整体构象,如蛋白的折叠、胞内定位、细胞间的相互识别等,即糖链影响了由构象决定的蛋白的所有功能。因此研究糖蛋白的功能,不仅要分析蛋白质,也要分析糖链的组成。

近年来以质谱为核心的糖蛋白质组学正成为解析糖链、修饰位点和蛋白的主要技术,但糖链的多样性增加了糖肽鉴定的复杂性,而且糖链本身也容易被串联质谱碎裂,且糖链的碎裂能量与肽段不相同,因此亟需一种更完善、准确可靠的方法流程解析糖链、肽段和蛋白。

中科新生命推出完整N-糖肽蛋白质组学分析服务,通过HILIC 富集方法,并结合最新一代超高分辨质谱,实现N-糖基化位点和糖型组成的完整解析和糖基化的大规模定性定量分析,让糖组学研究唾手可得。自此中科新生命建立了O-GlcNAc糖基化组学、完整N糖肽组学和N糖基化修饰组学全面的糖基化组学服务。

完整N-糖肽实验流程图

三大产品特色

1.完整N-糖肽蛋白质一站式多维分析,提供修饰组学研究更创新研究方案

完整N-糖肽蛋白组学仅通过一次实验,可同时分析糖链+修饰位点+修饰肽段+修饰蛋白, 实现糖基化研究多维度分析结果,一站式解析糖型、糖基化位点、糖基化肽段和蛋白。并且样本类型兼容性广泛,血浆、细胞、组织样本等均可友好适用。完整N-糖肽为血液样本的创新研究提供了新的选择。

图1 完整N-糖肽解析结果示例

2.采用pGlyco 3.0高准确度糖型分析软件

近年来,国内外都开发了不少解析完整N-糖肽的相关软件,但目前解析方法仍有明显的局限性:大部分工具无法对糖链的鉴定进行质控,尤其涉及到复杂的糖型时;检索速度慢;无法对多个糖基化位点精准定位;无法鉴定含有修饰糖单元的完整糖肽等问题。

中科新生命推出的完整N-糖肽组的分析软件为pGlyco 3.0,该软件是目前首个提出聚糖优先的糖肽搜索引擎,该方法的特色是先搜索糖链部分,通过糖链鉴定的质控,缩小搜索空间从而提高检索速度,并且过滤掉不可靠的糖型从而提高鉴定精度。此外对于含有多个糖基化修饰位点的糖肽,pGlyco 3.0采用动态规划算法对糖基化位点进行精准定位。至此,pGlyco 3.0实现了从糖链、多肽和糖肽三个层面的质控保证了结果的准确性和可靠性。

图2 多种完整N-糖肽软件的比较分析(pGlyco 3.0 vs Byonic vs MSFragger vs MetaMorpheux)

(pGlyco 3.0在准确度和搜索速度上均有明显的优势)

3.高特异性、高通量、无偏向的N糖基化富集方法

完整N-糖肽组采用亲水相互作用色谱法--ZIC-HILIC对糖蛋白进行富集分析,该方法可以实现对完整N-糖肽无偏向、高特异性、高通量的富集。

图3 多种糖蛋白富集方法的比较分析(ZIC-HILIC vs HILIC vs 酰肼化学法 vs TiO2

(①HILIC和ZIC-HILIC得到的N -糖肽数量相当(分别为1118和1138);但ZIC-HILIC的富集特异性 (46%)高于HILIC(34%)②在四种富集技术中,酰肼化学富集特异性最高(93%),但鉴定出的N-糖肽数量相对较少(667),在TiO2色谱中,特异性富集含有唾液酸的糖肽,富集得到318个唾液糖肽,特异性仅为26%)

应用领域推荐
完整N-糖肽组学主要应用于生物标志物、分子分型和修饰表达谱领域和方向。

相关公司:上海中科新生命生物科技有限公司
联系电话:021-54665263
E-mail:marketing@aptbiotech.com


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