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质谱扫描SARS-CoV-SNP鉴定新冠与萨斯获国家专利
点击次数:5239 发布日期:2021-5-17  来源:本站 本站原创,转载请注明出处
质谱扫描SARS-CoV-SNP二维码鉴定新冠与萨斯
2021年5月11日获国家发明专利
 

中国检验检疫科学研究院与北京万泉麟科技有限公司合作,于2020年8月研发《质谱扫描SARS-CoV-SNP》,成功用于模拟SARS-CoV和SARS-CoV2病毒的检测与鉴定,并于2021年5月11日获得国家知识产权局授予发明专利授权ZL202010874232.5。

为了快速应对突如其来的SARS相关冠状病毒物种的袭击,有必要研发“一种能够通过SNP检测和鉴定SARS相关冠状病毒的通用试剂盒”,该试剂盒不仅能够超高灵敏度精确检测和区分已有的SARS-CoV和SARS-CoV-2病毒,而且还能够用于对未来可能发生的新型冠状病毒SARS-CoV-3,4,n进行迅速、有效、及时的监控和预警,为人类预防未来新型冠状病毒及其变种再次来袭,提供强有力的快速侦测工具。

经几千例SARS-CoV相关病毒全基因组DNA条形码序列分析,从10个基因区域( 5UTR, L, RdRp, ZD, S, EC3, M, N, O10, 3UTR )中筛选出能够区分SARS-CoV与SARS-CoV2的种特异性SNP保守位点,建立SARS-CoV相关病毒DNA二维码识别标志。(见表1)
 
表1. SARS-CoV相关病毒DNA二维码识别标志

 
注:设计十组引物和探针,分别靶向以上10个SNP位点。
采用多重PCR-MS精细测序。根据四碱基单点延伸组合,区分SARS-CoV与SARS-CoV-2,并预测未来可能出现的SARS-CoV-3,4,….n,真正做到防患于未然。(见图1)
 
 

图1. RdRp SNP检测质谱图
 
注:1. 左图:RdRp 探针峰为6381.1 Da,经单碱延伸反应后未移动为阴性;2、中图:经单碱延伸后,峰移至6652.4 Da即A碱基工作,为SARS-2
3、右图:经单碱延伸后,峰移至6668.4Da 即G碱基工作,SARS-CoV
4、当出现C/T时,则预示出现新SARS-Cov-n
 
目前获得CFDA批准的商用试剂盒,有单靶区段(ORF1ab)、双靶区段(ORF1ab、N蛋白)、三靶区段(ORF1ab、N蛋白和E蛋白)的试剂,用于检测SARS-CoV-2。
本发明的创造性在于,使用一套引物探针,同时检测两种完全不同种的病毒,不仅节省了合成引物的检测成本,而且大大提高了检测灵敏度,相当于一次对一个样本作了10次单色PCR,5次双色PCR, 2.5次4色PCR。不仅可以提高检测易变异和降解的RNA病毒的灵敏度,有效避免目前商用试剂1-2探针PCR检测引起的低载量SARS-CoV-2病毒漏检。而且可以用于对未来可能再次来袭的新SARS-CoV-3,4 …n,进行预警。(见图2)
 
SARS-CoV2 positive report SARS-CoV positive report

图2. 质谱扫描自动报告结果
 
在此发明之前,众所周知PCR-MS法定义为只能用于检测已知序列,不能用于检测未知。而本发明第一次提出能够用于预测未知物种的发生,将PCR-MS质谱精细测序的作用发挥到了一个崭新的阶段。
 
中国检验检疫科学研究院是国家设立的公益性检验检测检疫中央研究机构,主要任务是开展检验检测检疫应用研究,以及相关基础、高新技术和软科学研究,着重解决检验检测检疫工作中带有全局性、综合性、关键性、突发性、基础性的科学技术问题,为国家检验检测检疫决策、市场综合监管和质量安全提升提供技术支持。

北京万泉麟科技有限公司专一致力于基于质谱的病原微生物检测试剂盒研发与服务,拥有自主知识产权的《质谱扫描病原体MasScan®Pathogens》和《质谱扫描SNP二维码分型MasScan® SNP2D》系列产品,重点关注与人类癌症息息相关的“18种生物致癌因子”和“65种α属粘膜皮肤高危HR-HPV及54种β属皮肤致癌致疣HPV”等检测。
 
相关公司:北京万泉麟科技有限公司
联系电话:+86 10-83297188
E-mail:masscan@onespringtech.com


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