世界首个质谱扫描人乳头瘤病毒HPV双基因分型问世
浏览次数:4662 发布日期:2012-11-29
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美国西格诺公司—北京分部快讯

世界首个质谱扫描31种人乳头瘤病毒HPV双基因分型问世
经中国医学科学院和第四军医大学与美国西格诺公司合作,联合研究开发的多重PCR-Mass质谱扫描法,于2012年11月9日被美国临床微生物杂志Journal of Clinical Microbiology接收网上发表。
该研究揭示,在女性宫颈癌中HPV检出率>97%,主要为15种高危型;而男同性恋MSM者中,HPV感染型已经超过30种型,特别是>10种型的高混合型感染的严重程度,已经远超过女性的>5种型的程度,其对健康的影响目前还鲜为人知,应当受到高度关注。
该方法用于检测世界卫生组织国际肿瘤研究机构(WHO_ IARC)公布的30种与妇女子宫颈病变相关HPV基因型,包括:15种致癌高危型:16,18,31,33,35,39,45,51,52,56,58,59,68,73,82;3种可能致癌高危型:26,53,66;及12种低危型:6,11,40,42,43,44,54,61,70,
72,81/CP8304和89/CP6108型;以及男性同性恋中高发的84型。检测探针针对两个基因区,致癌性早期转录E6基因和衣壳蛋白晚期转录L1基因,避免了因病毒整合、变异或样本降解而造成的假阴性问题。经两轮扩增和采用先进的飞行质谱MALDI扫描,软件自动分析报告HPV基因型结果,避免了人为目测判断造成的误差,检测灵敏度高达单拷贝/反应。
经对200份同性恋肛拭子DNA标本检测,发现64.5%(129/200) HPV阳性,其中混合型感染者51.9% (67/129),最高达12种,总共检出31种HPV类型。
经对135例宫颈癌组织标本作对比实验,质谱法与凯普法(GA,CE,SFDA认证) 分别检出HPV基因型为15种和11种,阳性率为97% (131/135) 和90.4% (122/135)。质谱法与凯普法所检测的阳性标本122例和阴性标本4例完全吻合,用测序法补充验证9例凯普检测阴性的标本,结果与质谱法完全一致。质谱法与凯普法分别检出混合型感染者55.6%(75/135) 和25.2% (34/135),发现最高混合型分别为6种和3种HPV类型。
该方法的主要优势:
高特异性:在高重数引物设计、试剂遴选及特异甄别等方面独具匠心,彻底解决了目前多重探针混合,识别相似基因序列易产生交叉错配的假阳性问题。经几千例样本测试和测序比对,特异性达100%。
高灵敏度:双基因探针、两轮PCR扩增和高特异性探针单碱基延伸反应,飞行质谱扫描,显著提高了检测致病HPV基因型的灵敏度,解决了现行试剂盒中因采用E或L单基因探针检测而出现的结果不一致性及其所致的假阴性问题,达到每个反应单拷贝水平。
防污染:封闭式单孔完成全部反应,无须清洗,产物可即时降解。
通量灵活:每天检测10-1000份样本,每板可检测7800重反应。
高自动化:软件实时判读检测结果,避免了目测判读的人为误差。
低成本:毋需荧光标记,5µL反应体系,试剂用量低。
本方法广泛适用于转化医学研究的各种男女性临床样本:血液、尿液、细胞、咽拭子、肛拭子、新鲜组织及福尔马林固定石蜡包埋组织中31种HPV病毒DNA的分型测试。
本项服务将首先在国内首批医学独立实验室北京德易医检开展。
服务地址:北京市西城区新街口外大街8号
联系热线:masscan2012@yahoo.com
仪器信息:美国西格诺公司 www.sequenom.com
邮箱:jguo@sequenom.com