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百趣生物年度重磅升级:发现代谢组学HD
点击次数:935 发布日期:2021-11-19  来源:本站 本站原创,转载请注明出处
「发现代谢组学」系列产品致力于用体系的力量解决无限的需求,而「发现代谢组学HD」作为「发现代谢组学」的升级产品,凭借仪器性能的提升和数据库的升级,能够大幅提升代谢物的检测数量和准确性。

发现代谢组学HD实测结果——代谢物「多」且「准」

物质检出数量翻倍

近日,我们针对亲水和MIX两大体系完成了升级,随机对血清、尿液、动物组织、植物组织等多种样本类型进行了实测。
升级后的「发现代谢组学HD-亲水版」,物质检出数量平均为升级前的241%,物质定性数量为139%。以人血清样本为例,物质检出数量平均提升了96%,物质定性数量平均提升了29%

 


升级后的「发现代谢组学HD-MIX版」,物质检出数量平均为升级前的193%,物质定性数量为134%。以小鼠血清样本为例,物质检出数量平均提升57%,物质定性数量平均提升75%
 


B(i)级别可靠鉴定代谢物20%
配合最新优化升级的数据库,参考2021年最新NATURE METHODS(IF=28.547)[1]对代谢物的鉴定级别进行了注释,「发现代谢组学HD」系列产品各种类型样本B(i)级别鉴定代谢物平均占比可达到20%。基于非靶向技术的核心优势,随着数据库的迭代升级,可以对已检出的数据进行反复挖掘,对未知物进行更深度的注释及提高物质鉴定的可靠性。
(P.S.BIOTREE对「发现代谢组学HD」系列产品提供免费数据再次挖掘服务)
 


 

发现代谢组学HD两大升级


1. 仪器性能的提升
使用Thermo Orbitrap Exploris 120高分辨质谱仪器平台,在性能和质量精度方面都有很大提升,从而采集到更多的代谢物信号。
 


2.数据库的升级
为了充分利用代谢组学数据,我们需要在不同的实验室之间进行可比性。考虑到不同技术手段产出的数据存在差异,在发表的论文中,需要标明物质注释的相关信息,其中代谢物注释的可靠等级尤为重要,BIOTREE对数据库进行了全面的升级提供了代谢物注释的分类等级,「发现代谢组学HD」系列产品可以提供达到B(i)级别的代谢物鉴定。

参考上文提到的NATURE METHODS建议,代谢物鉴定级别:
A 标准品靶向验证或NMR鉴定
B(i) 基于标品数据库MS/MS 的可靠匹配
B(ii) 基于模拟数据库 MS/MS 的可靠匹配
B(iii) 基于MS/MS 的部分匹配
C(i ) 基于标品数据库MSn 的可靠匹配
C(ii) 基于模拟数据库 MSn 的可靠匹配
C(iii) 基于 MSn 的部分匹配
D 基于MS的匹配


参考文献
[1] Alseekh S, Aharoni A, Brotman Y, et al. Mass spectrometry-based metabolomics: a guide for annotation, quantification and best reporting practices. Nat Methods. 2021 Jul;18(7):747-756. doi: 10.1038/s41592-021-01197-1. Epub 2021 Jul 8. PMID: 34239102.

 

相关公司:上海百趣生物医学科技有限公司
联系电话:021-61531195
E-mail:chengyichun@biotree.cn


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