研究人员借助罗氏454测序系统破译南极冰层宏基因组

 

多年来，位于德国 Bremerhaven的Alfred Wegener极地与海洋研究所（AWI）的研究人员一直在研究极地和海洋环境，以加强我们对海洋-冰-大气交互作用以及北极和南极的动植物王国的了解。现在，AWI 的研究人员在Klaus Valentin 和他的同事— 来自东英格利亚大学的Thomas Mock 的牵头下，宣布他们计划对生活在北极海冰里的多种多样的生物进行首次宏基因组学分析。他们准备采用在由罗氏旗下的 454生命科学公司举办的10 GB（Gigabase）免费测序项目中获得的亚军奖项的资助下来完成该项目。宏基因组测序能帮助研究人员详细地查看某个复杂样本里的种系组成和功能多样性，近年来454测序系统已启用了其中大部分的序列。

 

Alfred Wegener 研究所和东英格利亚大学在之前实施的项目中已完成了对海洋冰藻和细菌的基因组测序。此外，他们还测序了海冰物种及群落的转录组— 这些研究的目标是破译促使这些物种在基因上适应南极极端环境的活性基因。作为此项新的宏基因组学研究的一部分，研究人员准备对北极冰层中发现的一整套微生物进行分析，希望找到这些微生物中未开启的基因。

 

Valentin 说：“为了解基因组中仍在沉睡的基因，我们将同时对活性和惰性基因进行测序。如果诸如气温、二氧化碳浓度或光照强度等环境因素在未来发生变化，那么了解极地生物群落具备哪些基因潜力来对抗气候变化是很重要的。”

 

过去几十年来，气候变化已对北极的生态系统造成了巨大的影响，包括海冰、森林和冻原。随着北极气温的升高，栖息在北极地区的植物、动物和细菌种群要么被迫适应环境的变化，要么只能走向毁灭。

 

罗氏454生命科学公司的总裁兼CEO Chris McLeod说：“我们很高兴看到454测序技术被应用于极地生物群落研究的重要领域。他们的研究结果将有助于更好地了解全球气候变暖对两极地区的影响。”

 

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