北京2009年7月--来自冷泉港实验室(CSHL)和安捷伦科技公司(NYSE: A)的研究小组,共同开发了针对新一代大规模平行DNA测序技术的补充方案,使用定制芯片对感兴趣的基因组区域进行靶向捕获。该方法发表在Nature Protocols (vol.4, No.6)上,从芯片捕获到Illumina Genome Analyzer的分析,通常只须9到10天即可完成。
“通过定制芯片上的杂交选择进行靶向重测序,为解决众多遗传问题(包括肿瘤遗传学)提供了直接而经济的策略,”论文的第一作者, CSHL研究员Emily Hodges博士说,“便捷的芯片,结合现成的试剂,构成了一个便于使用的重测序平台,可针对研究者各自感兴趣的课题重新配置。 ”
“我们很荣幸能与CSHL Gregory Hannon博士的实验室合作,”合作作者,安捷伦生命科学部 Andy Bhattacharjee博士说,“芯片捕获技术简便、适用性好、耐用性高,有效解决了新一代测序在样品制备上存在的瓶颈问题。而且,芯片设计具有高度的可定制性和简便性,可适用于对其它已知序列真核生物基因组进行靶向捕获。”
阅读全文,“Hybrid selection of discrete genomic intervals on custom-designed microarrays for massively parallel sequencing”可链接 www.nature.com/nprot/journal/v4/n6/full/nprot.2009.68.html (需订阅)。