罗氏 NimbleGen 在全球范围占领定向重测序市场
浏览次数:4171 发布日期:2009-2-2
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NimbleGen 序列捕获芯片迅速成为全球高通量测序实验室的样品制备方法之选世界各地的研究人员纷纷采用罗氏NimbleGen 序列捕获芯片以及相关仪器和试剂盒来加速疾病(如癌症和糖尿病)研究中的样品制备,这意味着罗氏 NimbleGen 正在占领全球定向重测序市场。定向重测序可让科学家们只捕获人类基因组上感兴趣的区域,并利用高通量的测序系统,如454 生命科学的Genome Sequencer FLX 仪器,来评估捕获片断中的遗传变异。NimbleGen 序列捕获产品的应用与传统的实验室方法相比,简化了这些基因组区域的捕获,可令研究人员更快进入测序阶段。
基因组捕获技术已经成为科研实验室的宝贵工具,尤其是在美国明尼苏达州的梅奥诊所,这里也是美国较早接受NimbleGen 序列捕获芯片的早期使用者。梅奥诊所实验室医学及病理学的助理教授,同时也是分子遗传学实验室的联合主管,Matthew J.Ferber 博士表示:“NimbleGen 序列捕获芯片提供了一项极具前景的强大技术,让我们实验室快速开发出大量的定向基因测序分析,并可轻松融入454 测序流水线。”
NimbleGen序列捕获芯片同时也成为测序服务供应商实验室的研究工具之一,譬如法国巴黎的Genoscope – CEA。其基因组资源部门的主管Gábor Gyapay博士提到:“在我们研究罕见单基因遗传病的工作中,如果疾病基因所在的间隔超过几百kb,那简直不可能用PCR的方法来制备测序样品。利用NimbleGen Sequence 385K芯片,我们能够捕获大小在几百万个碱基的区域,并利用Genome Sequencer FLX仪器对样品进行测序。初期的结果让我们非常兴奋。” Gyapay博士高度赞扬了技术的易用性:“罗氏NimbleGen的详细步骤很有用,它以清晰的解说方式指导你操作每一步。我很欣赏在每个质量控制步骤都提供了预期结果的图片。”
作为NimbleGen 序列捕获芯片在加拿大的早期采用者,加拿大安大略癌症研究所癌症基因组学和高通量筛选的平台主管- John McPherson 博士已经在他的实验室牢固确立了这种技术。“全基因组测序对于我们想要处理的样品数量来说还是太昂贵了。定向重测序让我们能分析更多的基因组。我们初次尝试就富集到了目标区域,目前我们仍在优化步骤,让它适用于其他的测序平台。来自罗氏的这台仪器很奏效,让整个过程很容易操作。”
在2009 年1 月,Roche NimbleGen 推出了人外显组捕获产品,它利用了优化的设计算法(2008 年10 月推出的385K 平台),提供了迄今为止表现最佳,功能最强大的NimbleGen 序列捕获芯片设计。这种优化设计的目标是以相等的效率捕获所有目标区域,并全面减少所需的测序,从而降低测序费用。人外显组产品是建立在新的高密度HD2(210 万个长寡核苷酸探针)平台上的NimbleGen 序列捕获芯片。此产品能在单个芯片上捕获人基因组的几乎所有编码区域(约18 万个人编码外显子和约700 个miRNA 外显子)。它为研究人员提供了比传统PCR 方法更简单经济的外显子样品制备方案,可用于旨在阐明人遗传变异复杂度的研究推理中。
现在有了罗氏认证的NimbleGen 序列捕获培训师提供的3 天客户现场研讨会,这项新技术在客户实验室的开展就变得很简单。培训师能对客户进行385K 和2.1M 捕获步骤的培训。
Roche NimbleGen 是具有专利的DNA 微阵列、耗材、仪器和服务的领先创造者、生产商和供应商。Roche NimbleGen 生产长寡核苷酸探针的高密度微阵列,为基因组和表观基因组变异的研究提供了更多的信息和更高质量的数据。这种性能的提高是通过Roche NimbleGen 专利的无膜芯片合成(MAS)技术,该技术使用了数字光处理和快速、高产的光化学技术,以极高的灵活性合成长寡核苷酸、高密度的DNA 微阵列。关于Roche NimbleGen 的更多信息,请访问公司网站www.nimblegen.com。