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1644
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ChIP-seq等揭示热休克转录因子A1b调控植物高温胁迫响应的分子机制
2023-4-24
在拟南芥中,热休克转录因子A1b(HEAT SHOCK TRANSCRIPTION FACTORA1b,HSFA1b)通过影响种子产量来调控对环境胁迫的抗性。HSFA1b是生殖适应性的决定性因素,这种调控机制怎么形成的呢?2018年,
1830
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高通量测序后的下游实验验证方法之ChIP-seq介绍
2023-3-28
此前,我们分享了染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)的数据挖掘思路,进而筛选出TF结合/组蛋白修饰的目标区域和候选靶基因。做完ChIP-seq测序后,如果需要对分析结果中感兴趣的内容进行后期验证,
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次
染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)的数据挖掘思路
2023-3-27
CHIP-seq研究的数据挖掘思路主要分为3步:1. 整体把握CHIP-seq图谱特征:peak/reads在基因组上的分布、peak在元件上的富集、peak在基因元件上的分布、peak的motif分析、peak距离TSS位点的距离分
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次
ChIP-seq(组蛋白)揭示H3K36me修饰影响温度诱导的植物可变剪接和开花
2023-2-22
2017年,荷兰瓦格宁根大学分子实验室RGH Immink团队以“Histone H3 lysine 36 methylation affects temperature-induced alternative splicing and flowering in plants”在《Genome
7517
次
定量分析ChIP-qPCR数据的方法:Percent Input法和富集倍数法步骤介绍
2023-2-22
ChIP-qPCR 数据需要针对可变性来源进行标准化,包括染色质数量、免疫沉淀的效率(富集效率)和 DNA 回收率。两种常用的标准化 ChIP-qPCR 数据方法——Percent Input法和富集倍数法(F
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染色质免疫共沉淀ChIP实验的详细实验步骤
2023-2-10
染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP),是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典方法。开始 ChIP 之前要考虑三件事(1)为您的实验查找适合的抗体(2)优化染色质剪切(3)评估您
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次
ChipCytometry在深度挖掘FFPE石蜡组织切片空间蛋白组学信息的应用
2022-1-4
组织微环境的深度剖析对于理解疾病生物学机制及进展至关重要。在前面一期分享中,ChipCytometry技术的生物标志物空间剖析与数据分析能力完美结合让大家印象深刻(Chipcytometry:让生物标志物分
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次
微环境多靶标蛋白分析系统在细胞组织水平、分子机理等多领域的应用
2021-5-11
Chipcytometry 微环境多靶标蛋白分析系统是一种高质量的多重生物标志物成像分析技术,整合了创造性的样品存储技术、多重多通道检测技术和基于图像的单细胞分析方法,从根本上突破了传统方法的各
3825
次
揭秘神经发育过程中m6A-RNA甲基化与组蛋白修饰间的关系
2020-10-20
文章导读表观转录组学的研究在生物发育和疾病相关性等方面正越来越引起人们的关注。其中m6A修饰的研究是表观转录组学研究的一大热点。研究表明,m6A标签在mRNA和lncRNA中超过10,000种,并且m6A参
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次
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用
2020-7-9
文章导读表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形
584 次
DAP-seq技术助力胡杨耐盐机制的研究
2020-4-21
2019年9月,北京林业大学和蓝景科信合作,在植物学主流学术期刊Journal of Experimental Botany上(IF=5.36),发表了题为“Populus euphratica WRKY1 binds the promoter of H+-ATPase
5630
次
国自然研究热点—eccDNA的前世今生
2020-3-18
1. eccDNA为什么火?它到底是何方神圣?2019年11月,顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)的重要研究,彻底颠覆
1830
次
睾丸间质细胞(LCs)m6A修饰提供新治疗靶点在不育症治疗方向的应用
2020-3-4
文章导读m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰,目前已有的研究表明m6A在加速mRNA代谢和翻译,以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。这一次,研究重大发现m6A修饰在“人类
4249
次
揭秘m6A修饰新功能 -- 调控染色质状态和转录活性
2020-1-20
文章导读m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码
3202
次
新型超微量染色质免疫共沉淀ChIP-seq技术-Cut&Tag
2020-1-12
文章导读染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation , ChIP)是研究蛋白质与DNA互作的标准方法。通过与高通量测序技术相结合,研究者开发了ChIP-seq技术,从而获得全基因组范围内与组蛋白
2501
次
植物染色质免疫沉淀试剂盒(CHIP)的使用
2019-10-15
蛋白质和DNA的相互作用是调控细胞反应过程的要素之一。染色质免疫沉淀分析方法(chromatin immunoprecipitation, CHIP)是研究活体内DNA和蛋白质的相互作用的最新最有力的研究工具。CHIP技术通过
7018
次
Millipore试剂盒推荐使用Q800R3设备剪切染色质
2019-6-11
染色质通常被认为是由DNA、组蛋白和非组蛋白组成的复合体。RNA染色质复合体的成分被认为是由mRNA或传统的snRNA组成,它在转录过程中短暂地与染色质相关联。然而,越来越多的证据表明各种类型的非
4852
次
看这里!miRNA怎样蹭上m6A热点发高分?
2019-5-27
文章导读胰腺癌是一种恶性程度很高,诊断和治疗都很困难的消化道恶性肿瘤,约90%为起源于腺管上皮的导管腺癌。其发病率和死亡率近年来明显上升。5年生存率<1%,是预后最差的恶性肿瘤之一。m6
5525
次
Nature Cell Biology:外泌体LncRNA帮助免疫细胞“叛变”----乳腺癌恶化新机制!
2019-4-26
文章导读:外泌体是细胞间传递信号的媒介,直径在30-200nm,表面具有磷脂双分子层,内部具有丰富内含物的小囊泡,其内含物包括miRNA,环状RNA,LncRNA和mRNA等。以不久前发表于Nature Cell Biol
6084
次
circRNA再发IF=18.88高分文章--circRNA机制研究汇总
2019-4-18
circRNA再发IF=18.88高分文章--您想知道的circRNA机制研究,都在这儿……文章导读超强子调控circRNA-Nfix缺失诱导成年小鼠心肌梗死后再生circRNAs正在成为心脏发育和疾病强有力的调
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