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文库片段筛选技术流程

浏览次数:705 发布日期:2025-3-19  来源:本站 仅供参考,谢绝转载,否则责任自负
磁珠进行核酸片段筛选的步骤基于SPRI技术和磁场分离原理,通过磁珠与DNA片段的特异性结合实现目标片段的分离。以下是具体操作流程及关键要点:

一、实验准备
  1. 磁珠平衡
    将磁珠从冰箱取出,室温平衡至少30分钟,避免低温破坏表面修饰基团。
  2. 试剂配制
    • 现用现配80%无水乙醇(体积比8:2)。
    • 根据目标片段大小选择磁珠比例(参考各厂家磁珠分选比例表)。

二、双轮分选法(适用于NGS文库构建)
第一轮:去除大片段(右侧清除)
  1. 磁珠与样本混合
    按比例(如0.8×)加入磁珠至DNA溶液中,涡旋混匀或移液器吹打10次,室温孵育5分钟。
  2. 磁场分离
    短暂离心后置于磁力架(如达远辰光磁力架),待溶液澄清(约5分钟),转移上清至新管,残留2μL液体于原管底部,避免吸到磁珠。
第二轮:去除小片段(左侧清除)
  1. 加入第二轮磁珠
    按比例(如0.2×)加入磁珠至第一轮上清中,重复混匀、孵育步骤。
  2. 磁场分离与洗脱
    • 分离后弃上清,用80%乙醇漂洗磁珠2次(每次30秒)。
    • 室温干燥磁珠至刚出现龟裂(约5分钟),避免过度干燥。
    • 加入ddH₂O或TE洗脱DNA,室温孵育5分钟后回收上清。

三、单侧分选法(适用于去除短片段)
  1. 调整磁珠比例
    根据目标片段长度选择磁珠用量(如去除≥1000bp片段用0.6×,去除≥200bp用2.0×)。
  2. 结合与分离
    • 混匀磁珠与样本后孵育5分钟,磁力架分离并弃上清。
    • 乙醇漂洗后洗脱DNA,适用于去除引物二聚体或短片段杂质。

四、关键注意事项
  1. 分选精度控制
    • 第一轮弃磁珠,第二轮弃上清,确保目标片段被保留。
    • 使用Qsep、Agilent 2100 Bioanalyzer验证分选后片段分布。
  2. 操作误差规避
    • 转移上清时使用200μL+10μL枪头,防止吸到磁珠。
    • 初始体积≥100μL,不足时补超纯水以减少移液误差。

五、应用场景示例
  • NGS文库构建:通过双轮分选获得300-500bp目标片段。
  • 病原体检测:快速分离特定长度的病毒核酸片段。
如需具体磁珠比例表或实验参数,可参考厂商提供的说明书(如UltraBio™ II DNA磁珠分选指南)。
发布者:深圳达远辰光科技有限公司
联系电话:0755-86727654
E-mail:marketing@longlightech.com

标签: 磁珠分选
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