Affymetrix CNV芯片

       拷贝数变异（CNV）是由基因组发生重排而导致的，一种大小介于1 KB至3 MB的DNA片段变异，广泛分布于人类基因组中，主要形式有亚显微水平的缺失和重复，是导致许多人类疾病如癌症、遗传性疾病、心血管疾病等的重要原因。目前，染色体水平的缺失、扩增等变化已成为许多疾病研究的热点。Affymetrix CNV芯片是一种基于全基因组拷贝数微阵列技术的检测方法，可检测如拷贝数增加和减少、杂合性缺失（loss of heterozygosity，LOH）、拷贝数平衡杂合性缺失（copy neutral loss of heterozygosity，cnLOH）、倍性、等位基因特定变化、断裂点测定、嵌合、克隆异质性和染色体碎裂。

Affymetrix CytoScan™ HD芯片
实验流程


产品特点
1、目前密度最高的细胞遗传学芯片。含有超过270万种探针，同时具备CNV探针和SNP探针，平均覆盖全基因组，对于＞40kb的基因组结构变异检出率达99%。SNP探针进行SNP分型的准确率高于99%。
2、实现低水平嵌合发现、LOH和获得性 UPD (aUPD) 检测、拷贝数变化确认、三倍体检测、等位基因失衡模式发现、基因组污染鉴定、trio一致性检查及家系分析。
3、基因覆盖全面。拥有超过 260 万个拷贝数探针，涵盖了所有 OMIM™ 和 RefSeq 基因。

样本要求：DNA≥1.0μg ； 物种：人


Affymetrix OncoScan™ 芯片
实验流程


产品特点
1、使用分子倒置探针(MIP)技术，针对FFPE样本优化设计（探针结合处只需40bp的碱基）。
2、全基因组拷贝数分析，检测基因结构变异，如缺失、重复、LOH、cnLOH、断裂点测定、倍性、嵌合和不平衡易位。
3、所需起始DNA量少（仅需 80 ng FFPE来源DNA），陈旧FFPE样本也有效（10年或者更久）。
4、结果稳定性高，不同批次之间以及不同操作员之间均可得出标准化结果。
5、在特定癌症基因中进行高分辨率拷贝数检测，能准确识别极小(50‒125 kb) 至大 (Mb) 范围内的变异。

样本要求： DNA≥80 ng ，FFPE 切片（10片以上，切片厚度10μm左右，面积250mm2左右）；物种： 人

       上海生物芯片有限公司成立于2001年8月，公司由上海科技创业投资（集团）有限公司、上海张江（集团）有限公司、中科院上海有关院所、上海交通大学等在上海的国内知名大学、研究所、医院和企业共同组建而成，经国家发展与改革委员会批准公司建设和运行“生物芯片上海国家工程研究中心”，是我国生物医药领域规模最大的生物技术国家工程研究中心之一，是全国生物样本标准化技术委员会（TC559）、中国医药生物技术协会组织生物样本库分会（BBCMBA）与中国抗癌协会肿瘤样本整合研究分会的秘书处与主任委员单位。

       通过二十余年的建设和发展，公司（中心）确立了以生物样本库、基因芯片、高通量测序、蛋白芯片、组织芯片、数字化病理、分子病理与生物信息学为核心平台的技术创新服务体系，以分子医学检测技术和分子诊断产品研发生产为核心竞争力的产业化体系，形成科研和药物研发技术服务、分子诊断产品研发生产销售和分子医学检验三大主营业务，公司（中心）具备科研及公共技术平台服务优势、成熟的科技成果转化服务能力、国家工程研究中心品牌影响力等强大的自身资源及优势。