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基于国际领先的蛋白质谱数据库搜索结果评估工具Scaffold，着重介绍如何根据目前三大最主要的蛋白质谱搜索引擎Mascot、SEQUEST和X!Tandem的分析结果，进行合理的评估和整合，从而大大增加蛋白质谱鉴定的准确性和客观性，帮助用户更好更全面地理解质谱分析的结果。 |
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重要特性 |
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SF3格式文件可以使运算速度更快，性能更稳定 Scaffold所支持的新的文件格式SF3，不但使得数据处理的速度更快，而且还增强了不限文件大小的可扩展性。用户可以在更短的时间内提交更多的数据。并且SF3格式甚至可以直接支持下一代质谱仪的数据输出。 |
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| 广泛的数据兼容性和分析处理工具 Scaffold3支持的各类搜库软件的搜库结果分析比较，包括Mascot(可以直接提取服务器上的搜库结果), Sequest, X!Tandem, Phenyx, SpectrumMill, OMSSA, ZCore, Maxquant和IdentityE。支持各类实验设计分析，包括单个样本、MudPIT、SDS-LC等实验方法的数据文件。提供多种非标记定量方法对数据集进行快速定量、提供全面的高精度分析结果导出并能够自动产生所有MCP需要的数据文件，可以自动输出至Tranche服务器及HUPO-Psi标准数据结果 |
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强大的数据过滤强力 革命性的数据过滤功能！通过使用Venn图表以及深度过滤算法，可帮助用户最快地浏览数据文件。这项新的搜索功能包括了质谱名称、肽段序列，甚至序列模式(sequence motif)。 |
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全新的质谱高精度验证 运用专业的统计算法，可帮助用户大大提高针对质谱高精度数据的验证速度。根据每个样本数据，该软件还可自动转换偏差值和精度值，由此用户可以更好更深入地理解这些先进的质谱仪器产生的质谱数据！ |
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相关产品 >>>> Scaffold Q+S:定量分析工具； >>>> Scaffold DIA: 蛋白质组学非数据依赖型采集方法的定性、定量质谱数据的分析 >>>> Mascot Server: 蛋白质谱数据查询软件； >>>> Mascot Distiller: 蛋白质谱原始数据分析； |
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