应对蛋白质组学数据分析的挑战
质谱是蛋白质组学的核心分析技术,但是,大规模的蛋白质组学研究可产生大量
的质谱数据。将这些数据变成有意义的生物学信息是一个极大的挑战,每一比特的数据就像采集原始数据的量一样大。安捷伦的Spectrum Mill蛋白质组学数据分析平台提供了一套高级的软件工具,用于处理MS和MS/MS谱图,确定蛋白质种类和表达水平,并生成有意义的交叉样品和交叉实验结果总结。功能包括:
·消除噪音和数据库检索中不合格数据的MS/MS谱图提取和质量评价工具
·支持来自多种仪器类型的多种格式的数据分析
·突变鉴定、转录后变性(PTM),或者化学变性的MS或MS/MS数据的谱库
检检索
·自动和交互式结果认证,以及采用另外的参数,模式(强度,异体同形,具有
PTM的异体同形),或数据库进行重新检索
·对于一级表达水平比较进行基于质量的半定量分析,还支持全ICAT定量
·交叉实验结果总结
·对来自数据库中不存在的蛋白质的多肽进行De novo测序
这些功能仔细地集成在一个功能强大的MS蛋白质组学数据分析解决方案中。
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