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BSI携PEAKS系列新版本软件亮相美国第72届ASMS大会

浏览次数:336 发布日期:2024-6-11  来源:本站 本站原创,转载请注明出处
2024年6月2日-6月6日,第72届美国质谱年会(ASMS)在美国阿纳海姆隆重举行!BSI携最新版本的PEAKS®系列软件与DeepImmu®免疫肽组发现服务、PEAKS AB®多克隆抗体测序服务新品亮相大会!




PEAKS® 新版本软件亮点
  • 全面支持ThermoFisher Hybrid-DIA、AB SCIEX ZT Scan DIA数据的快速、准确分析;
  • 支持Bruker TimsTOF ddaPASEF抗体测序数据分析。
  • DeepNovo® Peptidome workflow算法升级,全面支持DDA和DIA数据的免疫肽组分析。
  • 免疫肽组分析支持基因关联、序列变异和翻译后修饰位点鉴定。
  • PEAKS DB search通过深度学习提升MS2评分,鉴定数量提升10%。
  • DIA数据分析性能大幅提升,速度更快、更灵敏、更准确,更好的短梯度数据分析支持。
会议期间,CTO辛磊博士受邀参加了深度学习从头测序算法的技术研讨会,在会上分享了PEAKS®算法团队在de novo sequencing领域多年的工作成果,以及deep learning技术当下的应用及对未来的展望。作为首个将深度学习应用到de novo sequencing的算法模型,BSI的DeepNovo®也得到后续众多算法的借鉴与引用。

此外,对于近几年大热的免疫多肽研究,会场的相关墙报几乎也成了PEAKS®专场。来自Helmboltz Institute of Translational Oncology Mainz,Genentech,The Children's Hospital of Philadelphia,Baylor college of Medicine, Roche, ADA Forsyth Institute,Regeneron等临床机构、制药公司,学术单位展示了他们利用PEAKS的DeepNovo Peptidome或者de novo sequencing工作流在免疫多肽组发现中的数据分析应用。蒙特利尔大学的Pierre Thibault教授也在口头报告中分享了他们在非小细胞肺癌方面利用PEAKS进行的相关工作成果。

本次会议BSI及百蓁生物共展出6张墙报,涉及新抗原发现方法和流程,多抗测序方法,从头测序算法,数据统计等方面,引起了众多业内同行的兴趣并讨论。TP 566 An AI-driven, proteogenomics-based and complete workflow for novel neoantigen discovery
Authors: Qing Zhang [1], Kyle Hoffman [1], Sahar Rabinoviz [1], Peng Chao [2], Haibo Bian [1], Wenting Li [1], Lei Xin [1], Baozhen Shan [1]
[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
[2] Baizhen Biotechnology (Shanghai) Co., Ltd., Shanghai 201112, China
ThP 058 A Bayesian model for estimating the posterior error probability and the false discovery rate of de novo peptide sequencing
Authors: Hieu Tran [1], Rui Qiao [1], Lei Xin [1], Baozhen Shan [1]
[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ONWP 047 Revolutionizing Proteomics: Ultra-Fast, High-Accuracy Peptide Sequencing with Enhanced GraphNovo AlgorithmAuthors: Zeping Mao [1], Lei Xin[1], Shengying Pan [1], Baozhen Shan [1]
[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
WP 704 Combining Top-Down and Bottom-Up Mass Spectrometry Paves the Way for High Throughput Polyclonal Antibody Sequencing
Authors: Lei Xin [1], Peng Chao [2], Jun Ma [2], Shuyang Zhang [1], Zihao Wang [1], Wenting Li [1], Kyle Hoffman [1], Ailee Aihemaiti [1], Baozhen Shan [1]
[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
[2] Baizhen Biotechnology (Shanghai) Co., Ltd., Shanghai 201112, China
MP 451 Confident identification of proteome-wide low-level mutations using PEAKS 11.5
Authors: Kyle Hoffman [1], Julie Genereaux [2], Lei Xin [1], Zia Rahman [1], Christopher J Brandl [2], Patrick O’Donoghue [2], Baozhen Shan [1]
[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
[2] Western University, London, ON
TP 576 Distinguishing MIPs in the cell surface or in processing by MS with Immunoprecipitation and Mild Acid Elution methods
Authors: Chao Peng[1], Ping Wu[1], Haofei Miao[1], Ling Li[1], Baozhen Shan [2]
[1] BaizhenBio (Wuhan) Inc., Hubei, China
[2] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON


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