English | 中文版 | 手机版 企业登录 | 个人登录 | 邮件订阅
当前位置 > 首页 > 行业资讯 > 讲座 > 讲座:GENEVESTIGATOR探究转录组数据中的基因表达

讲座:GENEVESTIGATOR探究转录组数据中的基因表达

浏览次数:548 发布日期:2024-5-11  来源:本站 本站原创,转载请注明出处

1715397952955092.png        

Immunai(NEBION)策划了从大块组织到单细胞的高质量公共转录组数据,与高性能但易于使用的工具GENEVESTIGATOR相结合,可以对公开转录组数据进行全局和即时分析,以实现新的发现和验证。

GENEVESTIGATOR涉及多种不同疾病,包括癌症、自身免疫、纤维化、心血管或代谢疾病。大多数研究来自人类、小鼠和大鼠的数据。

GENEVESTIGATOR使用受控词汇、领域专家的同行评审、严格的质量控制和强大的全球数据集成平台级标准化的分析工具。

大块组织(Bulk Tissue)转录组数据分析

2405112.jpg        

GENEVESTIGATOR同时分析数千项研究,以找到与药物或疾病特别相关的基因,或者寻找与基因特征相关的状况或疾病:

1.有效发现靶标和生物标志物

2.目标和生物标志物的直接优先级排序和验证

3.创新药物的再利用和重新定位

4.识别相关实验模型系统

5.可靠的副作用预测

6.通过干净的数据有效训练机器学习算法

7.可靠的数据驱动决策

  • 24051131.png
    选定的骨关节炎研究样本中TNFAIP6的表达
  • 24051141.png
    鉴定用于RT-qPCR分析的特异性参考基因
  • 24051151.png
    针对一组选定的实验条件对银屑病基因特征进行分层聚类

 

  • 24051161.png
    400多种不同的组织和细胞类型中CTLA4的表达水平
  • 24051171.png
    与1800多种其他疾病和实验条件下的表达相比,搜索因特应性皮炎而特异性上调的基因
  • 24051181.png
    火山图上显示了受损软骨组织和完整软骨组织之间差异表达的基因。可以选择基因的特定子集进行进一步分析

 

单细胞转录组(scRNA-seq)数据分析

与大块组织转录组数据的管理一致,scRNA-seq数据也是使用受控词汇、领域专家的同行评审和严格的质量控制。此外,还应用了最先进的细胞聚类、批次效应消除以及细胞类型识别和注释方法,为研究人员提供一致且可用于分析的数据概要。GENEVESTIGATOR由人类和小鼠scRNA-Seq数据组成,并提供不同的数据格式,供研究者使用喜欢的分析工具进行探索。

GENEVESTIGATOR现在可以使用其用户友好的可视化工具对来自公共存储库的深度策划的单细胞RNA-Seq数据进行分析。其独特的高质量和深度整理的数据集合使研究人员能够了解发育和疾病的分子机制,并揭示正常和患病组织中的细胞异质性。概要中一致的处理、管理、聚类、细胞类型识别和研究协调使用户能够节省时间和资源,并专注于解决跨越不同治疗领域的令人兴奋的问题。

1.获得全球范围内单细胞异质性的高分辨率视图

2.揭示复杂和稀有的细胞群

3.追踪不同细胞谱系在发育过程中或对刺激的反应轨迹

4.揭示细胞类型水平的调控关系以改进靶标发现

5.确定细胞类型特定疾病与生物标志物开发的关联

6.可靠的数据驱动决策

GENEVESTIGATOR以下领域的数据可用,每个领域都包含基线开创性研究和更具体的研究:

1.心血管系统

2.消化和内分泌系统

3.免疫系统

4.神经系统

5.肿瘤学

6.生殖和肾脏系统

7.呼吸系统

8.各种系统(目前有来自骨关节炎、皮肤科等的数据)

【点击查看】GENEVESTIGATOR案例:对10x RNA-Seq数据集的分析

【点击查看】GENEVESTIGATOR:单细胞转录组学数据分析

讲座主题:

利用GENEVESTIGATOR探索组织和单细胞转录组数据中的基因表达谱

讲座时间:

5月22日(周三)16:00-17:00

主讲嘉宾:

Frank Staubli博士

软件介绍:

GENEVESTIGATOR是基因表达的高性能搜索引擎。它集成了上万由专家人工统一精选、注释与归一化的公共大块组织和单细胞实验结果,将基因在不同的生物环境中,如疾病、药物、组织部位、肿瘤、细胞系或基因型中的表达进行了可视化,以探索不同生物环境下不同基因的表达情况以及基因与生物环境的潜在深层联系。

报名方式:

扫描下方二维码填写报名信息

522讲座表单.jpg

注:报名截止日期为5月20日。入会链接(Zoom)将于5月20日发送至您报名的邮箱,如未收到请联系我们!

关于本次会议的任何问题可联系康昱盛官方客服:

1663236978630678.jpg

 

 

 

相关公司:上海康昱盛信息科技有限公司
联系电话:021-54975000
E-mail:marketing@cloudscientific.com


用户名: 密码: 匿名 快速注册 忘记密码
评论只代表网友观点,不代表本站观点。 请输入验证码: 8795
Copyright(C) 1998-2024 生物器材网 电话:021-64166852;13621656896 E-mail:info@bio-equip.com