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代谢组学及网络药理学研究技术与实践培训班通知

浏览次数:1903 发布日期:2023-7-5  来源:本站 本站原创,转载请注明出处

代谢组学是近年发展快速的一门学科,目前在医学、植物学、微生物学、毒理学、药物研发等多个领域中得到了广泛的应用。如何从复杂的代谢组学数据中提取出有价值的信息,筛选出潜在的生物标志物成为近年来代谢组学研究的热点和难点。网络药理学能够通过计算机模拟算法、运用组学、高通量筛选及网络分析等技术揭露药物-靶点-疾病之间复杂的网络信号关系,已经成为揭示生物系统复杂功能和行为的有力工具。
 
课程特点:

实操干货,实际一线工作者的经验分享,在较短时间全面了解网络药理学与代谢组学技术相结合的概念,熟悉相关操作流程,明确流程中的关键点和易出错点,避免触碰雷区或走入误区,提供详实的方法资料,借助较流行的在线数据库及Cytoscape软件(无需编程),对网络药理学进行系统性学习(数据获取,网络构建,通路分析)及个性化问题解决,同时结合代谢组学数据进行整合分析,实现多技术交叉和多数据融合的高级数据解析思路和方案。
 
点击进入培训官网

课程安排:
 
日期 时间 授课题目 授课内容
7月8日 9:00-12:00 代谢组学研究技术与实践 1、代谢组学研究思路和流程,全局了解代谢领域新方向
1.1 代谢组学概述
1.2 代谢组学样本的采集、保存与制备的注意事宜
1.2 代谢组学的应用
2、代谢组学数据采集与预处理,决定数据统计结果的准确性
2.1 代谢组学相关平台介绍
2.2 常用软件和数据库介绍(数据采集、数据预处理、代谢物鉴定)
2.3 数据预处理与分析
3、基于SIMCA-P软件的代谢组学数据多元统计分析与实操
3.1 样本分类(PCA、PLS-DA、OPLS-DA)
3.2 差异变量筛选(S-plot、S+V-plot、VIP等)
3.3 常见图形结果解读
12:00-14:00 午间休息
14:00-17:00 网络药理学研究技术与实践 4、网络药理学研究思路和流程
5、网络药理学数据分析与实操
5.1 化学成分的获取与筛选(Pubchem、TCMSP数据库、TCMID数据库、Swiss ADME数据库等)
5.2 中药化学成分靶点获取(TCMSP数据库、BATMAN-TCM数据库、Similarity Ensemble Approach (SEA)数据库、Swiss Target Prediction数据库、HIT2.0、HERB等)
5.3 疾病靶点富集数据库(DisGeNET数据库、GeneCards数据库、OMIM数据库等)
5.4 化合物与疾病靶点映射(韦恩图)
5.5 PPI网络分析(PPI网络构建、网络拓扑特征的计算、网络拓扑指标的含义、重要节点识别)
5.6 富集分析(DAVID数据库、Metascape数据库、KOBAS数据库)
5.7 通路可视化分析工具(气泡图、柱状图)
5.8 靶点组织定位分析
5.9 网络图构建—Cytoscape(数据导入、节点关系的建立、节点属性计算、调整网络样式、筛选及过滤、网络图导出)
5.10 分子对接 
7月9日 9:00-12:00 代谢组学与网络药理学结合研究技术与实践 6、为什么要在网络药理学中结合中药代谢组?
7、代谢组学与网络药理学结合研究思路
8、代谢组学与网络药理学结合分析技术
8.1 代谢组学与网络药理学数据的获取(HMDB数据库、成分靶点获取、疾病靶点富集数据库、 代谢专属数据库)
8.2 代谢组学功能分析(富集分析、通路分析等)
8.3 代谢小分子网络关联分析(Metscape软件、OmicsNet数据库)
8.4 代谢物-代谢物网络的构建与分析
8.5 代谢组学与网络药理学功能层次关联分析
12:00-14:00 午间休息
14:00-17:00 文献解读及实例解析 9、文献解读:代谢组学与网络药理学结合的文章分析流程和套路
9.1 中药化学成分靶点与代谢小分子网络分析实例(Food Res Int.2020,136:109503)
创新点:采用Metscape软件对代谢组学发现的差异代谢物和中药成分的药物靶点关联,聚焦关键蛋白。
9.2 代谢组学与网络药理学功能层次关联分析实例(JEthnopharmacol.2021,264:113281. )
创新点:采用功能富集工具分别对网络药理学和代谢组学数据进行关联,聚焦关键通路。
9.3代谢组学和网络药理关联分析实例(Comput Struct Biotechnol J.2021,19:1002-1013)
创新点:整合代谢组学和网络药理学,从代谢小分子网络和代谢组学功能分析出发,多维度聚焦关键通路和关键蛋白。
10、实例解析与练习
11、代谢组学与网络药理学结合文章写作规范
12、《网络药理学评价方法指南》解读
13、代谢组学与网络药理学结合项目设计解析
 
 
主讲专家:

本次课程由工作在科研一线的老师(讲师)担任主讲,在国内外学术期刊发表研究论文57篇,其中SCI收录16篇。近几年主持/参与国家自然科学基金和省自然科学基金多项。从事代谢组学和网络药理学技术研究近十年,熟练相关技术流程和操作方法,研究方向为中药网络药理学及中药代谢组学。

会议费用:
会议费3000元/人,同一单位3人以上参会优惠至2800元/人。此次课程为线上直播教学模式,开课前统一提供配套电子版培训资料。参加培训的学员课后可通过微信群继续和授课讲师交流,长期获得指导机会。
 
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会议咨询:
章老师 13121195178(微信同号)
E-mail:info@huasitai.com
 
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