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讲座报名:CCDC-GOLD 系列讲座
点击次数:530 发布日期:2022-11-30  来源:本站 本站原创,转载请注明出处

系列讲座主题:

主题一:初识GOLD:GOLD的对接原理及其性能介绍

主题二:大批量的分子对接:如何使用GOLD进行虚拟筛选

主题三:如何使用GOLD进行含有水分子或金属离子体系的分子对接
 

报名方式:

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一、初识GOLD:GOLD的对接原理及其性能介绍

Basic introduction of GOLD: the genetic algorithm and the performance of GOLD

时间:11月24日(周四)下午15:00-16:00
 

此次讲座您将了解到GOLD的遗传算法、四种常用的打分函数等理论知识,同时我们将通过一个案例分析,为您介绍GOLD分子对接的流程、关键参数的设置及结果分析的方法。

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二、大批量的分子对接:如何使用GOLD进行虚拟筛选

Ultra-large docking: Using GOLD for High throughput virtual screening

时间:12月08日(周四)下午15:00-16:00 
 

虚拟筛选可以通过计算机模拟帮助研发工作人员快速的在海量化合物中筛选出具有目标靶蛋白活性的先导化合物,大大节省了实验时间和成本。目前GOLD支持在PC端、HPC集群或云端进行大批量虚拟筛选工作,此次讲座您将了解到如何使用GOLD进行虚拟筛选工作,以及如何进行虚拟筛选结果分析等。

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三、如何使用GOLD进行含有水分子或金属离子体系的分子对接

Docking with and without water using GOLD: Identify the solvated intermediate ligand-protein interaction

时间:12月22日(周四)下午15:00-16:00 
 

水在蛋白质-配体结合过程中的作用至关重要。在基于结构的药物设计中,人们通常对配体进行优化以取代蛋白质结合口袋中能量不利的水分子。有些蛋白体系含有金属离子或金属离子复合物比如CPY450酶等,金属离子能与蛋白或小分子形成配位键,但是配位键模型在经典的力场中比较难以准确描述。

在GOLD 中凭借CSD 数据库中大量的含金属的晶体结构,GOLD对于金属离子的相互作用构型等有较好理解,因此特别适用于含金属离子的体系对接。

此次讲座您将了解到如何分析结合口袋中的水分子和金属离子的作用,并使用GOLD进行含有水分子或金属离子体系的分子对接。

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相关公司:上海康昱盛信息科技有限公司
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