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伯豪生物开工福利,935K甲基化芯片促销更有好礼相送

浏览次数:1798 发布日期:2024-2-19  来源:本站 本站原创,转载请注明出处

935K甲基化芯片(Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip Kit)是一种全基因组甲基化筛选工具,靶向人类甲基化组最具生物学意义的区域中超过 935,000个CpG 位点,同时在其前代产品MethylationEPIC v1.0(850K)的基础上极大的提高了向后兼容性。该芯片保留了以单核苷酸分辨率定量分析全基因组CpG的能力,同时提供高度准确和精确的甲基化测量,不受测序深度的影响。可使用精简、用户友好的Infinium甲基化检测分析多种DNA样本类型,包括从FFPE分离的DNA 样本。与其他方法相比,MethylationEPIC v2.0具有可扩展性和更低的单个样本总成本,因此可用于探究疾病机制和生物标志物的筛选。

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项目周期:DNA质控合格后标准生信分析结果发送,10个工作日;
交付结果:标准生信分析报告和原始数据;
DNA要求:常规DNA总量≥1ug,浓度≥50ng/μl,OD260/280 在1.8左右;不得有其它个体或其它物种的DNA或RNA污染;溶解在H20或TE (pH 8.0),特殊样本视具体情况实验。

活动时间:2024年2月18日至5月31日

活动说明:1.活动时间为合同签订时间;2.单次送样数目为8的倍数;3.活动最终解释权归伯豪生物所有。
 

935K芯片优势

▪全面的基因组覆盖范围:检测> 935,000个CpG位点,全面覆盖CpG岛、启动子、编码区及增强子。
▪探针位点的全面优化:在EPICv1.0-850K的基础上去除了性能不佳的探针,新增186,000个CpG靶向增强子和超级增强子、更多CTCF结合位点、CNV检测区域、EPIC v1.0覆盖不足的CpG岛以及常见癌症驱动突变。

▪兼容多种样本类型:包括FFPE、新鲜/冷冻组织、全血、口腔细胞、cfDNA、唾液和其他样本类型。
▪高质量的数据:沿用了450K芯片的Infinium技术,同时采用Infinium I及II探针设计,使检测范围最大化。
▪分辨率高:单碱基分辨率,可以直接检测到发生甲基化的准确位点。
▪可重复性高:自身技术重复间的相关性以及与850K相同探针间的相关性R2>0.99。
▪注释信息:人参考基因组版本更新到hg38,GenCode数据库更新到v41版本。
 

935K与850K芯片数据相关性

935K甲基化芯片检测能够检测到0.2的beta值差异,假阳性率低于1%,从而实现了较高的分析灵敏度,同时也具有极好的数据可重现性。如下图(A)935K芯片技术重复相关性R2>0.99;(B)935K芯片和850K的交集探针间的相关性R2>0.99;(C)935K芯片数据与甲基化测序(100×测序深度)的相关性R2>96%。

935K芯片实测数据展示

严格按照Illumina Infinium® MethylationEPICv2 BeadChip(简称935K)操作手册完成DNA抽提、转化、扩增、杂交洗脱等,质控结果说明杂交实验过程稳定、转化率高、荧光信号和结合状况良好,综合说明实验操作稳定,可以进一步做甲基化的数据分析。 


关于伯豪生物
伯豪生物已累计为客户完成千余例表观遗传科研服务项目,涉及组织、细胞、全血、FFPE、唾液、ctDNA等各种实验样本数万例,涵盖肿瘤、胚胎发育、复杂疾病等各个领域,伯豪生物客户使用甲基化芯片、甲基化捕获测序(MC-seq)、全基因组甲基化测序(WGBS)、m6A-seq和焦磷酸测序等甲基化研究技术分别在Theranostics、ACS Nano、Front Cell Dev Biol.、PNAS、Ann Rheum Di等期刊发表论文。

相关公司:上海伯豪生物技术有限公司
联系电话:021-58955370
E-mail:market@shbio.com


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