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txyz.ai助力EAD:SCIEX发布AI释读7600系统新应用案例

浏览次数:1163 发布日期:2023-11-17  来源:SCIEX
SCIEX高分辨质谱 ZenoTOF® 7600 系统自2021年发布以来,各种学科的科学家利用其新型的电子活化解离(Electron Activated Dissociation, EAD)技术结合Molecule Profiler和Biologics Explorer等数据处理软件,在生物药、脂质分子,代谢组学、脂质生物标志物等方面促进了科学研究。尤其在分子结构解析、糖苷类代谢位点确证、脂质分子中双键的定位,离子型脂质降解产物的鉴定等应用方向,提供了非常可靠的高分辨质谱数据。我们精选了4篇新进EAD应用案例,论文原文语言为英文,共计22页。近日,该内容经汇总正式上线,可免费下载。
 
 
想了解EAD的新进应用,难道必须要读完22页英文论文?这需要花费不少的时间和精力。
遇事不决,可问txyz.ai和SCIEX。介绍一个好用的读学术内容的工具(txyz.ai),可以直接在浏览器输入txyz.ai登陆。我们用AI释读这4篇应用案例,然后,又请了 SCIEX专家从质谱和软件的角度释读案例。只把简洁的精华技术内容呈现给您。
 
扫描二维码,下载新进EAD应用案例
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应用案例1. 
抗体药物偶联物(ADC)抗体比(DAR)测定
SCIEX专家从质谱和软件的角度释读
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使用ZenoTOF 7600 系统对恩美曲妥珠单抗 (T-DM1) 的糖基化和去糖基化形式进行了表征,然后使用Biologics Explorer软件进行了自动数据分析 (上图),从而实现了精确的DAR测量。糖基化 (天然) 和去糖基化形式的曲妥珠单抗 (T-DM1) 的平均DAR值分别为3.6和3.5。糖基化T-DM1的MS谱由不同的质荷比组成,主要是G0F、G1F和G2F 与多达8个有效质荷比DM1偶联分子,去除N连接的糖基化则有更简单的MS谱,其中检测到去糖基化的T-DM1携带多达8个DM1。
 
利用ZenoTOF 7600 系统的EAD功能,进行精确的完整质量测量和由Biologics Explorer软件提供的自动数据注释,可快速进行蛋白质鉴定和DAR测定。
 
AI释读
这篇论文介绍了使用LC-MS分析完整的糖基化和去糖基化ADC样品的过程。研究使用Waters ACQUITY BEH C4柱和Exion LC AD系统对样品进行分离,LC运行的流速为0.3毫升/分钟,柱温保持在60摄氏度。质谱分析使用ZenoTOF 7600 系统进行,数据处理则使用Biologics Explorer软件。研究结果显示,通过这种组合可以准确测量和自动解释完整ADC的分析数据。对T-DM1的糖基化和去糖基化形式进行了DAR值测定,分别为3.6%和3.5%。研究还指出Biologics Explorer软件提供了简化的工作流程,可用于确定ADC的药物-抗体比(DAR)。总体而言,该研究展示了使用LC-MS和Biologics Explorer软件进行完整ADC分析的可行性和有效性。
 
 
应用案例2. 
离子型脂质纳米颗粒DODAP及其降解产物的自动表征  
SCIEX专家从质谱和软件的角度释读
 
本工作展示了离子型脂质体1,2-二磺酰-3-三甲基铵丙烷 (DODAP) 在降解和氧化过程中的综合表征。EAD产生大量的诊断离子,这些离子在单电荷脂质的碰撞诱导解离 (CID) 模式下,呈现得并不好,但对结构注释很重要。Molecule Profiler软件通过自动注释信息丰富的基于EAD的MS/MS数据,提供结构解析。这个工作流程有助于理解在脂质纳米颗粒 (LNP) 配方中使用的离子型脂质的降解规律。
 
 
Molecule Profiler软件显示DODAP降解物结构表征。图A显示了m/z 384.3的EAD MS/MS谱图,展示了高置信度的鉴定和结构解析。当一个峰被分配给一个选择的的结构或分子式时,该峰值将以浅蓝色显示。图B显示了图A中给出的质谱对应的结构。图C显示了与图B中匹配的结构相对应的已选碎片离子列表。
 
EAD技术生成丰富的MS/MS数据,对DODAP、氧化形式及其降解物进行了可靠的鉴定,具有优异的质量精度,Molecule Profiler软件加快了自动识别、确定结构和相对定量DODAP及其相关杂质的过程。
 
AI释读
这篇论文介绍了使用ZenoTOF 7600 系统和Molecule Profiler软件对DODAP及其降解产物和氧化形式进行反相LC-MS分析的结果。色谱分离显示DODAP的主峰在15.5分钟处,未经处理的DODAP样品中存在多个降解产物,其中主要的降解峰在3.15分钟处。研究结果表明DODAP易于降解。Molecule Profiler软件被用于识别DODAP杂质,并自动确定每个杂质的相对丰度。通过高分辨率的ZenoTOF 7600 系统,实现了出色的质量准确度。研究还使用EAD MS/MS谱图和Molecule Profiler软件对DODAP及其降解产物和氧化形式的结构进行了详细表征。该研究提供了一种完整的离子化脂质特性分析解决方案,并可以用于药物疗效和安全性评估以及新合成脂质的设计。
  
  

应该案例3. 
碰撞诱导解离(CID)和电子活化解离(EAD)技术对药物代谢物鉴定
SCIEX专家从质谱和软件的角度释读
 
在药物发现的早期阶段,对肝微粒体测定来研究代谢清除率和代谢位点。ZenoTOF 7600 系统和Molecule Profiler软件的代谢物鉴定工作流程,快速易用的工作流程生成信息数据,加快了早期药物发现过程。
  
 
上图显示使用Molecule Profiler软件自动化的结构解析,确认两种结合型生物转化物,包括去甲基化福莫特罗的代谢物及进一步的葡萄糖醛酸代谢物的结构鉴定,EAD的质谱数据能明确地确定葡萄醛酸代谢的途径。
  
ZenoTOF 7600 系统上的Molecule Profiler软件,可以对I相、II相和多种生物转化物代谢物进行自动结构分配。可靠的代谢物鉴定使用EAD MS/MS谱图、CID MS/MS谱较长或两者结合的独特离子进行分析。
 
AI释读
这篇论文介绍了使用ZenoTOF 7600 系统Molecule Profiler软件进行代谢物鉴定的软件辅助过程。该方法结合了CID和EAD数据,增加了代谢物结构鉴定的可信度。研究使用了ZenoTOF 7600 系统和Molecule Profiler软件生成了信息丰富的数据,加速了早期药物发现过程。
 
论文中提到,利用LC-MS工具进行微粒体测定可以估计代谢清除率和鉴定代谢位点。通过使用ZenoTOF 7600 系统和Molecule Profiler软件的先进代谢物鉴定工作流程,可以快速、简便地生成有用的数据,加速早期药物发现过程。
 

Molecule Profiler软件可以识别治疗分子中的生物转化。最新的更新使得该软件可以根据EAD和CID数据对生物转化的结构进行优先排序,非常适合比较MS/MS光谱并识别独特的片段。使用ZenoTOF 7600 系统和Molecule Profiler软件进行代谢物研究的关键特点包括增强的结构鉴定、可靠的结构鉴定、快速的代谢物鉴定和简化的数据采集和处理工作流程。
 

论文中还介绍了样品制备、色谱条件和质谱条件等实验方法。通过使用Zeno CID DDA和Zeno EAD DDA数据,结合Molecule Profiler软件,可以鉴定出相位I、相位II和生物转化组合代谢物。软件可以直接从SCIEX OS软件的Explorer模块导入MS/MS光谱,并进行结构鉴定。
 
论文的结论包括自动化的结构鉴定、利用Molecule Profiler软件识别EAD和CID MS/MS光谱中的独特片段、快速高效的软件辅助代谢物鉴定和相关分析、以及该工作流程的适应性和可扩展性。
 
总之,这篇论文介绍了使用ZenoTOF 7600 系统和Molecule Profiler软件进行代谢物鉴定的方法和工作流程,并展示了其在早期药物发现中的应用潜力。
 
 

应用案例4. 
精确质谱法鉴定脂质生物标志物

SCIEX专家从质谱和软件的角度释读
本工作描述了测定小鼠脑基质中葡萄糖基和半乳糖基神经酰胺的高分辨质谱方法。小鼠大脑含有许多内源性脂质生物标志物,这些标志物具有相似的结构,干扰非常普遍;分析揭示了新的干扰或在治疗组之间增加或减少的干扰。这些数据充分展示了潜在的生物标记物是如何识别的,可以获得更多关于目标样本的信息,有助于将这些物种作为其他潜在的生物标志物进行表征。
  
ZenoTOF 7600 系统是一种可以用于脂质生物标志物定性和定量分析的利器,具有高灵敏度和准确性。
 
AI释读
这篇论文介绍了使用SCIEX OS软件平台中的Formula Finder和ChemSpider工具来进行化合物鉴定的方法。通过准确质量TOF MS数据,Formula Finder确定可能的分子式,然后ChemSpider在其数据库中搜索与所提出的分子式匹配的条目。最后,ChemSpider生成一个命中计数,总结与前体质量和同位素谱图确定的分子式匹配的数据库条目数量。根据命中计数,用户选择最合适的分子式,并将其与数据库中的命中进行匹配。然后,通过比较理论碎片与收集到的MS/MS数据,提供碎片的百分比匹配,最终由用户做出最终选择。该方法在小鼠脑样本中鉴定干扰物和化合物的过程中展示了良好的效果。此外,论文还介绍了使用ZenoTOF 7600 系统进行脂质生物标志物的敏感定量分析的方法,并展示了其在低样本体积下实现高灵敏度的能力。最后,论文总结了该方法的优点,包括简单易行的样品鉴定和定量分析,以及在SCIEX OS软件提供的单一平台上实现的数据采集、处理和管理。
 
 
 
 
txyz.ai
请告诉我,什么是EAD
图为向txyz.ai就“EAD定义问题”问答情形展示
 
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  • “这篇文章使用了什么研究方法”
  • “这篇文章中有什么创新”
  • “文章中的提到EAD是什么”(如上图)等等。甚至还能用中文回答问题。
 
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