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CNS文章的生信分析培训班通知
点击次数:1529 发布日期:2021-12-28  来源:本站 本站原创,转载请注明出处
CNS文章的生信分析怎么做?包教包会学单细胞测序、chipseq、RNAseq、Atacseq、R语言
我们承诺: 1包教会,学不会一直免费学,直到您完全学懂、学会、学透彻为止
2,课后有完善的一对一指导服务,保证解决每个学员的所有问题
2022年1月4日开班 线上课程两个月 每周二四六晚上三个多小时
 
【课程简介】
学生信一次报班从此以后再也不用东拼西凑反复报名各类培训班,
系统学生信,一次学到位,包教包会。
二个月从零基础开始,精细化讲解 将生信内容全部学懂(理解)、学会(会敲代码分析)、学透彻(站在顶层设计角度理解)、学以致用(用到自己的标书申请和文章发表中)
学不会一直学,直到学会才毕业
【授课老师】
华哥:中山大学博士 指导过多篇CNS文章生信分析 参与多项国自然重点、国家重大专项、孔雀计划等项目申报 有多年生信教学经验,学员遍布协和、华西、湘雅、瑞金、中山医等著名医院
【课程安排】每周二四六晚上每节课三个多小时
第一节课:r语言基础学习 包括r和rstudio的安装、环境配置、数据结构等基础内容学习
第二节课:在实战中进一步提升对r语言的学习,主要以geo的芯片数据下载、整理、分析为主。
第三节课:芯片数据分析(主要系统指导如何使用geo数据库画生存曲线,以及无进展、无疾病、多分组的的生存曲线画图,包括热图 火山图 箱线图 小提琴图 )
第四节课:rnaseq数据分析(包括系统讲解主流的Deseq2、Edger、limma-voom三种差异分析的方法)
第五节课:基因集富集分析 gsva gsea kegg go富集 包括自定义基因集的富集分析以两篇nature子刊文章为例,系统讲解如何进行参数调整得到符合文章趋势的富集结果
第六节课:tcga 数据下载 整理 差异分析 结果画图展示
第七节课:非监督共识聚类算法系统讲解以两篇cell文章为例 通路分组的生存曲线 转录因子富集
第八节课:wgcna算法系统讲解以nature文章为例,系统讲解三种免疫浸润的算法,以及三种算法的具体应用场景和区别以及参数调整技巧
第九节课 :单细胞数据读取以nature文章为例,创建seurat对象 质控 s4对象的数据结构的系统讲解
第十节课:继续以nature文章为例系统阐释降维、聚类等概念,细胞亚群注释三种方法
第十一节课:多个样本整合的单细胞数据分析 包括锚定和harmony两种主流的单细胞数据整合算法,同时讲解多线程运算原理和实操。
第十二节课:单细胞差异分析 metadata理解 分组添加 可视化画图 热图 气泡图
第十三节课:以nature文章为例系统auc算法计算通路活性,单细胞差异基因的富集分析 gsea 亚群的gsva  auc 转录因子预测
第十四节课:系统讲解拟时间分析 包括monocle2 和monocle3 做3d拟时间
第十五节课:系统讲解scenic算法 转录调控网络分析
第十六节课:系统讲解cellphonedb、cellchat、italk三种主流分析细胞互作的软件
第十七节课:infercnv和以cell文章为例的自定义算法的染色体拷贝数变异
第十八节课:单细胞非负矩阵 cnn降维 非共识聚类 以及单细胞的wgcna
第十九节课:以cell文章为例 系统讲解单细胞的RNA velocity应用
第二十节课:系统学习linux操作系统 chipseq全流程分析以nature文章为例 包括质控 上数据比对 、MACS2、IGV进行可视化
第二十一节课:chipseq下游的motif富集 不同处理直接的峰值overlap韦恩图 差异paek寻找 peak注释 以cell文章为例超级增强子寻找
第二十二节课:Atacpseq全流程分析包括MappingQC、多个重复样本合并、Peakcalling、bedGraphToBigWig、TSS Enrichment、bedtools计算overlap、IDR评估、可视化。
第二十三节课:WES分析、gatk使用、VCF下游分析、annovar注释
第二十四节课: 单细胞空间转录组的注释以及可视化
第二十五节课:以优秀标书为例,讲解如何将所学生信分析应用于国自然标书申请+课程大总结
 
【主办单位】
玮瑜科研平台(上海玮瑜生物科技有限公司)
【承办单位】
上海玮瑜生物科技有限公司
上海焦务科技服务中心
【培训时间】
2022年1月4日开始
【注册费用】
注册费用:8800元/人
可开会务、注册、检测、分析服务等发票
【缴费账号】
A:汇款账户
户 名:上海焦务科技服务中心  账户号:9734 0078 8012 0000 0311
开 户 行:上海浦东发展银行大华支行 
B:支付宝转账
收款人:wybiot@163.com   支付宝户名:上海玮瑜生物科技有限公司
C:信用卡或公务卡支付
微信或支付宝扫描二维码支付,通过信用卡/公务卡扣款
【联系人】
联系人:谢老师 13611825136     
报名邮箱: wybiot@126.com

参考附件:报名回执表

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