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2022生信热点班报名通知
点击次数:1542 发布日期:2021-12-23  来源:本站 本站原创,转载请注明出处
紧扣生信热点零基础到手握5+生信热点分文章
这是史无前例的实战课程,你收获的不只是5天的互动教学课程,
你收获的是课后1对1的指导和个人文章批改,是科研思维的洗礼。
一次报课,一篇文章、终生受益。
(2022年1月3日-7日晚上,线上授课)
 
【课程内容】
1.零基础全面掌握生信核心知识点;
2.零基础学会SCI模块化写作思路和修稿策略;
3.极速写一篇SCI论文的核心思维和实操步骤;
4.零基础极速掌握R语言核心知识点。
5.百分百的售后,一次授课,终生答疑。
【授课老师】
百川,百川科研公众号创建者,211/985大学教授,发表SCI文章50余篇,数家SCI杂志审稿人,资深职业写手,擅长SCI文章撰写与修稿,具有多年生信培训经验,学员反响热烈。本次将倾情奉献,从构文思路、到实操步骤、到写作指导、到投稿修稿,提供一站式指导,课程紧紧围绕差异分析、泛癌分析、多组学分析、多芯片联合分析、批量生存分析、信号通路的筛选、蛋白互作、免疫微环境、ceRNA网络、单细胞测序、实验关键基因的筛选、基因Signature的筛选、预测模型的建立、预测模型的评价、LASSO回归、Nomogram诺模图、ROC曲线、以及最新的热点(课上内容)等等进行抽吸剥茧的精讲,现场指导写作,课程结束当天能够写成自己的文章初稿。
【课程目标】
(1)没有课题时,自己找到课题;没有机制时,自己找到机制;
(2)让自己SCI文章或国自然项目内容更夯实,思路逻辑更完美;
(3)思路缺乏创新性,怎么办?老师给你最新的生信分析热点;
(4)掌握R语言的核心技能,掌握批量分析方法,掌握顶层计算机思维体系;
(5)掌握生信SCI写作思路和修稿思路;
(6)掌握生信分析的独家套路(5个套路供你选择);
【课程内生信核心内容】
(1)配对/多组差异分析;(2)蛋白质相互作用网络;(3) 免疫微环境;(4)ceRNA网络构建;(5)细胞焦亡的分析流程;(6)批量生存分析;(7)预测模型的建立及评价;(8)Cytoscape软件精讲;(9)实验基因的寻找与生信验证;(10)单基因泛癌分析;(11)多组学分析;(12)多芯片联合分析;(13)实验信号通路的筛选;(14)基因Signature的构建;(15)生信预测模型的建立;(16)预测模型的评价;(17)Cox回归;(18)LASSO回归;(19)Nomogram诺模图(20)ROC曲线;(21)单细胞测序核心知识点;(22)单细胞测序数据的整理;(23)单细胞测序数据的质控;(24)降维分析;(25)聚类分析;(26)单细胞测序细胞亚群的区分;(27)单细胞测序数据的差异分析;(28)单细胞测序细胞群的注释;(29)新的细胞亚群的鉴定;(30)如何结合生信热点发前沿文章。
【课程安排】
日期 课程主要内容
第1天
19:30-22:30
R语言基础知识介绍;R语言读入及读出; R包的多种安装模式; R包及bioconductor资源的使用; R语言数据框的操作; R语言数据结构及循环控制(向量、因子、矩阵、数据库、列表、for循环、if控制); DIY自己的人生第一个批量处理函数; R语言绘图原理及体系;R语言基本绘图和高级绘图精讲及实操;
GEO数据库介绍、下载、清洗和探针注释;TCGA数据的下载、清洗、不同类型数据的转换
第2天
19:30-22:30
多个GEO芯片联合分析的多种思路;
GEO芯片的probe探针的转化方法汇总
差异分析精讲(从表达矩阵的整理、归一化、标准化到差异分析、多组差异分析、配对差异分析)
差异基因的呈现(精美火山图、热图、PCA图、小提琴图)
GEO数据的处理流程演示及学员实战(数据清洗、热图、火山图、GO分析、KEGG分析、共表达分析)
R语言实现生存分析、功能注释(精美生存曲线图)
GSEA讲解及结果解读(精美GSEA图)
第3天
19:30-22:30
GSEA分析的全套流程讲解及结果的诠释(精美GSEA图)
两个基因相关性分析;
单基因生存分析
多基因生存分析
任意癌症任意基因在癌和癌旁的表达分析;
同一癌症不同亚型和不同分期的表达分析;
单基因在多个正常组织中的表达分析;
单基因在多个癌组织中的表达分析;
单基因在多个癌和癌旁中的表达分析;
预后模型类思路和实操精讲:基因Signature的构建;生信预测模型的建立;预测模型的评价; Cox回归; LASSO回归; Nomogram诺模图;ROC曲线。
第4天
19:30-22:30
蛋白互作网络构建、cytoscape的实操使用,MCODE的实操;
cytoHubba实操选取Hub genes(精美蛋白互作图)
多个GEO数据的分析思维及实操
ceRNA的理论讲解 mRNA incRNA miRNA的获取。ceRNA网络构建,ceRNA网络的验证 ceRNA网络的展示(发表极分子网络)
免疫微环境的理论讲解,免疫浸润实操:自己测序样本中免疫浸润
细胞丰度的计算;单基因表达与免疫细胞的影响、单基因突变与免疫细胞的影响、单基因拷贝数对免疫细胞的影响,免疫浸润细胞与临床因素的关系
单基因泛癌分析、泛癌表达量分析、泛癌生存分析 泛癌基因突变 泛癌免疫分析;
多组学分析;
第5天
19:30-22:30
单细胞测序的分析思路及操作流程(单细胞测序核心知识点;单细胞测序数据的整理;单细胞测序数据的质控;降维分析;聚类分析;单细胞测序细胞亚群的区分;单细胞测序数据的差异分析;单细胞测序细胞群的注释;新的细胞亚群的鉴定)
生信的其他应用(怎么利用TCGA/GEO数据库中找课题?怎么利用TCGA/GEO挖掘下游机制?如何利用TCGA/GEO数据库申请国自然?如何利用TCGA/GEO数据库发表文章?)
最新热点的分析思路指导(如何结合生信热点发前沿文章)
SCI文章模块化写作精讲和修稿策略,实例讲解:审稿人让补充实验,如何不做实验也能让审稿人满意。
实战环节:每个分析步骤的一步一步,“我在讲,你在做,不懂你就问”的DIY环节;
 【涉及的31个议题】
1,没有课题时,如何找课题、找线索、找机制?
2,后续细胞实验,如何精准找到下游作用通路或因子?
3,花钱测序回来的一堆结果,乱七八糟,怎么梳理、再分析成一篇SCI论文?
4,gene signature类文章的一些禁忌,哪些是评审专家特别看重,一票否决的点?
5,当下热门的免疫微环境是怎么回事,怎么利用自己的数据进行操作?
6,审稿人说只有生信分析,没有实验验证,怎么办?,
7, TCGA数据库中的数据,怎么下载,需要进行哪些数据清洗?
8,文章写好了,怎么选刊,避免踩雷?
9,WGCNA是什么东西,为什么是生信分析的神器?
10,生存分析有几种方案?怎么进行批量操作?
11,免疫浸润的计算方法有多少种,怎么多种方法批量分析?
12,目前有什么热点,怎么结合热点,发出不一样的生信文章?
13,单基因生信分析,能做到什么程度?
14,两个基因,能进行什么生信分析,产生多少结果用于SCI文章中?
15,一群基因,能进行什么生信分析,产生多少结果用于SCI文章中?
16,如何利用生信挖掘,没有试验前期,也能写课题中标书?
17,差异表达分析怎么做、配对样本怎么做,多组样本怎么做,小样本怎么做,大样本怎么做?
18,GSEA基因集富集分析,优点是什么,缺点是什么,怎么做?CNS的大牛文章中到底是怎么用GSEA的?怎么在文章或课题里利用GSEA加分?
19,ceRNA网络怎么构建? 对于mRNA,miRNA,lncRNA,cirRNA,我们应该做些什么?
20,GE0芯片数据,除了热图、火山图,还能做什么?
21,那么多GEO平台,如何以不变应万变的进行探针ID转换?
22,GEO多芯片数据,如何进行批次效应的处理?
23,ssGSEA算是批次效应的终结者吗?批次效应的终结者到底是什么?
24,如何对长链非编码RNA、假基因等一网打尽的注释?
25,单基因GSEA怎么做?有什么用途?跑出的结果怎么挑选和分析?
26,TCGA数据的正常和癌组织怎么分组,转移和未转移怎么分组,配对样本怎么挑选?
27,如何从TCGA数据中提取出lncRNA?
28,同一基因出现不同的分析结果,我该信谁?
29,做通路分析时,肺癌的数据聚类出肝癌的通路,这是怎么回事?
30,我想进一步学习,但害怕四处折腾踩雷,有什么避雷指南?
31,别人生信学3个月或学半年,我怎么学,才能后来居上,超过他们?
 
【主办单位】
玮瑜科研平台(上海玮瑜生物科技有限公司)
【承办单位】
上海玮瑜生物科技有限公司
上海焦务科技服务中心
【培训时间】
2022年1月3日-7日晚上
【注册费用】
注册费用:3200元/人
可开会务、注册、检测、分析服务等发票
【缴费账号】
A:汇款账户
户 名:上海焦务科技服务中心  
账户号:9734 0078 8012 0000 0311
开 户 行:上海浦东发展银行大华支行 
B:支付宝转账
收款人:wybiot@163.com   支付宝户名:上海玮瑜生物科技有限公司
C:信用卡或公务卡支付
微信或支付宝扫描二维码支付,通过信用卡/公务卡扣款
【联系人】
联系人:谢老师 13611825136     
报名邮箱:wybiot@126.com

参考附件:报名回执表

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