BluePippin回收大片段DNA用于Nanopore测序

 

2020年2月份发表在《PLOS GENETICS》上的一篇文章中，研究人员利用秀丽隐杆线虫Caenorhabditis elegans重组自交系(RIL)来研究遗传变异所导致的物种适应性变化。他们通过鉴定发现了一株具有高度环境适应性的虫株，此外该虫株对周围环境表现出了更强的探索性，而亲本株并不具备这些特征。对该虫株进行短读测序发现rcan-1基因发生了复杂的自发重排。利用Oxford Nanopore长读长测序技术将这种复杂的重排解析为5个独特的串联反转/重复。作者认为，新的生存环境可以产生进化压力，从而产生复杂的基因重排，这种重排除了可以增加基因拷贝数之外，还可以通过其他方式影响和改变基因表达。该文章中，BluePippin被用来分离和回收10-50kb的DNA片段，用于后续Oxford Nanopore MinION文库制备。

小编短评：BluePippin可用于三代长读长测序的文库构建，专门用于回收大片段DNA，可有效提升三代测序的效率，提高测序数据的N50值。是三代测序的标配工具。

图1：BluePippin用于Nanopore三代测序流程图

Sage Science是全球领先的研发和制造Pippin系列全自动核酸电泳片段回收仪的生产厂家，拥有美国技术专利，其生产的Sage系列产品可以高效完成不同长度范围的DNA片段的精准回收，广泛用于二代测序、三代测序以及多个分子生物学相关领域。
 
环亚生物科技有限公司作为美国Sage Science公司在中国区的独家代理商，自2011年以来将Sage Science的产品线引入国内，一直为国内用户提供专业的全自动核酸片段回收系统的安装测试、应用培训，技术支持与售后维护工作，赢得客户的一致好评与信任。环亚生物科技有限公司将一如既往地支持越来越多的Sage Science用户。

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