“从芯片到新一代测序”讲座-上海交大医学院（5.20）

 

表观遗传的改变（基因组DNA甲基化、组蛋白修饰等）以及转录因子与DNA的相互作用都可以在转录水平调控基因的表达，并与生物体正常生理过程以及疾病发生发展密切相关。讲座将介绍基于高通量芯片和Illumina GA IIx测序平台的高通量检测技术及应用：包括MeDIP-chip、ChIP-chip、MeDIP-Seq、ChIP-Seq。

 

长链非编码RNA(lncRNA)作为长度超过200nt的非编码RNA,与microRNA为代表的small ncRNA, 在表观遗传、转录及转录后等多个层面调控基因表达。讲座将介绍非编码RNA的多种研究方法及应用，包括microRNA表达谱芯片，最新推出的lncRNA表达谱芯片，以及Illumina GA IIx新一代测序技术在非编码RNA研究中的应用。

 

实时定量PCR芯片，结合了芯片高通量和实时定量PCR准确性的优点，广泛应用于各种疾病和正常生长发育机制的研究。讲座将系统介绍PCR array的应用，一次精确检测几十到几百个不同基因，有超过100种不同信号转导通路或疾病研究的方向可供选择；讲座还将介绍专门用于研究microRNA表达的PCR array。

 

全基因组表达谱芯片可一次性检测所有已知基因（mRNA）的表达水平，是目前应用最广泛的生物芯片技术平台。讲座将介绍表达谱芯片技术与生物学研究尤其是疾病研究的有效结合，重点涉及实验设计与芯片数据的深入挖掘。

 

 

时间：2010年5月20号（星期四）下午14：00-16：00（讲第二、第四部分）

地点：上海交通大学医学院5号楼11楼免疫学研究所会议室

          （上海市重庆南路280号5号楼11楼会议室）

 

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