转录组研究策略及RNA-seq数据分析6月专题培训班通知

浏览次数：3685　发布日期：2014-6-5　来源：本站　本站原创，转载请注明出处

转录组研究策略及RNA-seq数据分析专题强化培训班

2014年6月15日-20日，中国·青岛

转录组研究策略及RNA-seq数据分析专题强化培训班将于2014年06月15日-20日在青岛大学国际学术交流中心举办。本期培训班以第二代测序、第三代测序（单分子测序）在转录组学中的应用与RNA-seq数据分析为主题，精心设计了具有前沿性、实用性和针对性强的理论课程和上机课程。理论课程由担任国家973计划（转录组方向）首席科学家、国家自然科学基金重点专项负责人于军、胡松年等多位研究员亲自授课，上机课程由实践经验丰富的一线科研人员带领学员亲自实践RNA-seq数据分析流程。本班因老师时间的问题一年只举办一次，欢迎各领域广大科研工作者和高校教师及研究生积极报名参加！

主办单位

北京路思达生物信息科技有限公司

上海玮瑜生物科技有限公司

承办单位

上海陈珖文化传播有限公司

培训时间：2014年6月15日至20日（6月15日报到）

培训地点：青岛大学国际学术交流中心

课程安排

时间	课程内容	学时	讲师
06月15日（周日）全天	报到、注册
06月16日（周一） 9:00-12:00	转录组学发展前沿、科研思路及技术路线	3h	于军
06月16日（周一） 13:30~16:30	动物转录组项目研究讲解	3h	于军
06月17日（周二） 9:00-12:00	二代测序、三代测序在转录组学研究中的应用	3h	胡松年
06月17日（周二） 13:30~16:30	植物转录组、微生物转录组项目研究讲解	3h	胡松年
06月18日（周三） 9:00-12:00	二/三代测序仪原理介绍转录组建库实验流程详解（包括文库选择，测序文库构建注意事项）测序文库试剂的选择和使用心得等	3h	中科院专家
06月18日（周三） 13:30~16:30	转录组数据分析概述与经验交流（1）介绍转录组数据分析的整体流程：包括de novo转录组分析、有基因组reference的转录组分析、microRNA分析等。（2）转录组分析经验交流：包括测序量如何选择；测序质量如何评估；如何根据自己的实际情况选择mapping/denovo assembly软件；如何从转录组数据寻找生物学问题。 Linux常用基本命令 R语言应用简介	3h（上机）	中科院专家
06月19日（周四） 9:00-12:00	转录组denovo（无参考序列）测序数据拼接及分析：利用trinity实现转录组denovo组装，并进行预测蛋白序列、筛选差异基因及计算表达量等功能分析的讲解。	3h（上机）	中科院专家
06月19日（周四） 13:30~16:30	基于二代RNA-seq的差异基因分析（参照序列）：主要利用tophat和cufflinks,cuffdiff以及cummeRbund 等工具，实现reads的mapping, 转录本的重构，转录本的表达量计算，差异基因分析以及利用cummeRbund图形化展示cuffdiff的分析结果。GO、KEGG富集等功能分析。	3h（上机）	中科院专家
06月20日（周五） 9:00-12:00	miRNA二代测序数据分析 1. miRNA数据mapping的原理介绍及软件使用 2. 靶基因预测原理介绍及软件使用 3. miRNA数据库介绍及使用 4. miRNA的功能分析	3h(上机)	中科院专家