蛋白质组学及生物通路数据分析2013年冬季综合培训班
--暨第四届Mascot中国用户培训班
日期:2013年12月3日 – 12 月5日 (周二 ~ 周四) 9:00—17:00
地点:中国医学科学院基础医学研究所 北京市东城区东单三条五号 新教学科研楼506教室
主办单位:中国医学科学院基础医学研究所 协办单位: Matrix Science Ltd.
康昱盛科技有限公司 Proteome Software Inc.
Nonlinear Dynamics Ltd.
Ingenuity Systems Inc.
内容介绍及日程安排:
近年来蛋白质组学研究领域受到越来越多的关注,其实验平台和数据分析技术也在迅猛发展。随着高精度质谱仪的普及和技术提升,蛋白质组学已经进入了大数据时代!如何更加准确快速地处理和分析质谱仪得到的海量原始图谱,得到可信度高的鉴定结果和定量结果,以及如何利用现有的质谱技术进行翻译后修饰的深入研究和探索,这些都需要借助于分析算法和专业软件工具!这就给从事或即将进入该领域的科研工作者提出了更高的要求,需要更加系统地学习和掌握针对蛋白质谱的数据处理、数据分析,以及到组学后信息挖掘这一系列的流程和技术,才能更好地基于特定的生物学问题设计实验方案,选择合适的实验平台,并基于对应的数据分析工具,得到更准确更有说明力的生物学结论。本次培训班就是专门针对蛋白质组学的科研工作者,从初的谱图处理、到蛋白鉴定和定量、翻译后修饰、结果整合和评估,以及生物信息学深度挖掘和通路分析,提供一个全面且专业的综合性培训课程,帮助大家系统地学习这一整套数据分析流程的关键技术和进展,让您的知识储备和技术储备更全面更深入!
本次培训班是由具有实验平台和科研队伍的中国医学科学院基础医学研究所,以及专业提供蛋白质组学数据分析软件平台和解决方案的康昱盛科技有限公司共同举办。康昱盛公司是蛋白质谱搜库软件Mascot中国区的总经销商,从2010年起,已经成功举办了三届全国性的Mascot用户培训班,并为中国区的用户提供专业的技术支持和服务。本次培训班的授课老师均是长年工作的科研工作者,以及具有丰富实践经验的科学家!顺利完成本次培训的参会者,将会得到由中国医学科学院基础医学研究所及康昱盛科技有限公司联合颁发的培训证书。
本次培训涉及的软件分析平台包括:蛋白质谱鉴定工具Mascot Server, 标记定量软件Mascot Distiller,非标记定量分析软件Progenesis LC-MS, 蛋白鉴定及定量的多组数据整合和评估软件Scaffold & Scaffold Q+S,翻译后修饰评估软件Scaffold PTM,糖蛋白分析SimGlycan, 脂蛋白分析软件SimLipid,生物通路分析平台Ingenuity Pathway Analysis (IPA)。培训安排概述如下:
如果您只对基于各种组学数据的生物通路分析和深度信息挖掘感兴趣,请关注12月5日(即第三天)的培训安排,可单独报名!
详细的日程安排如下:
2013年12月3日星期二 质谱数据分析综述及蛋白鉴定和搜库
9:00 – 9:30 组委会主席开场致辞
9:30 – 10:00 蛋白质组学实验技术
10:00 – 10:30 蛋白质组学实验设计
10:30 – 10:45 茶歇
10:45 – 12:00 搜库基本原理介绍、Mascot的基本功能介绍
12:00 – 13:30 午餐及午休
13:30 – 14:30 Mascot搜索相关参数介绍
14:30 – 15:30 Mascot搜索基本练习
15:30 – 15:45 茶歇
15:45 – 16:15 基于LCMS的蛋白鉴定方法介绍
16:15 – 17:00 基于Scaffold的蛋白鉴定结果整合和评估
17:00 – 17:30 答疑
2013年12月4日星期三 标记定量与非标记定量技术介绍
9:00–9:30 标记定量方法介绍
9:30–10:30 化学试剂和代谢标记的数据处理介绍及Mascot Distiller练习
10:30–10:45 茶歇
10:45–12:00 基于Scaffold Q+S的蛋白定量结果整合和评估
12:00–13:30 午餐及午休
13:30–14:30 非标记定量介绍
14:30–15:30 基于MS1定量的非标定量介绍及Progenesis LC-MS练习
15:30–15:45 茶歇
15:45–16:15 De Novo Sequencing介绍
16:15–17:00 基于Scaffold PTM的翻译后修饰结果整合与评估
17:00–17:30 答疑
2013年12月5日星期四 基于蛋白质组学的通路分析及翻译后修饰
9:00–10:00 生物通路分析和深度信息挖掘综述
10:00–10:30 基于基因组学和蛋白质组学的生物通路分析流程介绍
10:30–10:45 茶歇
10:45–11:30 IPA数据查询和通路构建练习
11:30–12:00 IPA组学数据分析练习
12:00–13:30 午餐及午休
13:30–14:30 生物通路分析案例一:功能分类、通路富集、相互作用网络构建
14:30–15:30 生物通路分析案例二:上游调控因子分析、microRNA分析、Biomarker筛选
15:30–15:45 茶歇
15:45–16:15 IPA组学数据分析练习
16:15–17:00 糖蛋白、脂蛋白数据分析介绍
17:00–17:30 答疑
如何报名
请通过我们的网站直接报名:
http://www.cloudscientific.com/Detail/Activity/37.html
注:您提交报名信息后,我们会在两个工作日内回复您。若您在报名前有任何问题需要咨询我们,欢迎来电或来信:
Tel: 021-54975000
Email: marketing@cloudscientific.com
Fax: 021-64326060-804
价格及相关事项
1. 课程资料将以打印文件和刻录光盘的形式分发到参会者手中,若有做笔记的需要,请自带笔和本子。
2. 本次培训班为参会者提供上机电脑。如果您希望将相关试用软件安装在自己的电脑上,以便带回去学习以及分析自己的数据,也可带上自己的笔记本电脑(Intel内核,DVD光驱/USB接口,及WiFi无线网络端口)。DVD光驱用于运行培训中涉及到的几个软件工具,无线网络用于连接Matrix Science公共的Mascot服务器。
3. 收费标准为:
工业5000元/人,学术、科研人员4200元/人,学生3000元/人。
2013年11月10日前报名并付款,可享受特别优惠价:
工业4500元/人,学术、科研人员3700元/人,学生2500元/人。
*若单独参加第三天的IPA培训,收费如下:
工业1200元/人,学术、科研人员1000元/人,学生800元/人
*中国医学科学院协和下属的各研究所统一八折。
撤销注册及申请退款
已经付款的参会员,若临时有事不能前往,提前30天以上通知我们,可退还50%的费用;提前15天以上通知,可退还20%的费用。培训前开始前15天则不再接受退款申请,您可以邀请其它同事代替您参加。
付款方式:
网上汇款或银行转账
我司银行卡的信息为:
户名:上海康昱盛信息科技有限公司
帐号:31001632504052511198
开卡银行:中国建设银行上海体育场支行
如果您是柜台转账,请把转账票据传真给我们。传真号是:021-64326060-8004
如果您是网上转帐,请截取相关的图片发邮件给我们。邮箱地址:marketing@cloudscientific.com
收到款后我们会与您电话或E-mail确定。培训当天我司会根据您的要求为您开据发票。
培训地点及乘车路线
--培训地点:中国医学科学院基础医学研究所 北京市东城区东单三条五号新教学科研楼506教室
--乘车路线:
◇ 首都国际机场出发:机场专线(T2航站楼上,东直门下,2站),换地铁2号线(建国门下,3站),换地铁1号线(东单B东北口出,1站),下车向西北350米 (30公里/约1小时)
◇ 南苑机场出发: 机场专线(南苑机场站上,西单下,2站),换地铁1号线(东单B东北口出,4站),下车向西北350米(20公里/约1小时20分钟)
◇ 北京站出发:地铁2号线(北京站上,崇文门下,1站),换地铁5号线(东单B东北口出,1站),下车向北310米 (2.7公里/约20分钟)
◇ 北京南站出发:地铁4号线大兴线(北京南站上,西单下,4站),换地铁1号线(东单B东北口出,4站),下车向西北350米 (9公里/约30分钟)
◇ 北京西站出发:21路/320路专线/388路/99路(北京西站上,军事博物馆下),换地铁1号线(东单B东北口出,8站),下车向西北350米 (10.5公里/约40分钟)
◇ 北京北站出发: 地铁2号线(西直门上,复兴门下,3站),换地铁1号线(东单B东北口出,5站),下车向西北350米 (9.6公里/约30分钟)
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