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生物信息学基础语言-perl语言10月开班通知

浏览次数:15757 发布日期:2013-10-10  来源:本站 本站原创,转载请注明出处
Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员,且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加!
主办单位:北京市计算中心,生物计算事业部
举办地:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间:2013年10月22日-25日 
报名截止:2013年10月22日
培训内容及安排: 
日期
授课题目
授课内容
第一天
生物信息学与Perl语言概述
概括介绍生物信息学背景与Perl语言的概念及特点
软件安装与运行环境调试
Perl语言解释器、编辑器安装,Perl程序运行测试
基本操作与基本概念
DOS、Unix命令行操作基本命令;Perl语言基本变量与操作符
基本变量
变量、字符串赋值、基本运算等练习
第二天
基本语法结构
判断结构;循环结构;练习
数组及应用
数组的概念及用法;练习
第三天
文件与文件夹操作
文件的读入与输入;文件夹操作;练习
二维数组与hash表及应用
二维数组概念、关联数组(hash表)概念及用法;练习
常用函数及子程序
常用Perl语言基础函数学习;子程序概念与应用;练习
第四天
正则表达式及生物信息学Perl程序实例
Perl特色功能正则表达式学习与应用;生物信息学实例程序学习;练习
Bioperl简介、CPAN简介、常用生物信息学数据库与软件简介
Bioperl简介与安装;Perl第三方代码库CPAN简介;常用生物信息学数据库简介、数据类型与应用;常用生物信息学软件数据格式及软件应用简介
授课实例
1、生物学数据文件批量的合并、分隔、去冗余等。
2、生物信息序列数据fastq、fasta、genbank文件等格式转换与批量自动化处理。
3、按个性化实验需求,从生物信息学数据库文件(如genbank、EMBL)中批量自动化提取特定数据信息。
4、表格矩阵型数据的行列转换、特定数据信息的自动化过滤与数据筛选等。
5、二代测序原始数据的批量过滤处理,如barcode识别、质量值过滤等。
6、基因、蛋白质序列特定位点的识别,如起始、终止位点、ORF、motif、CDS等。
7、生物信息学数据序列特征提取与自动化统计,如GC百分含量、k-mer统计、基因反向互补转换等。
8、生物信息学数据库文件的批量自动化下载与信息提取(选学)。
(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)
【培训特色】
1、对口生物信息;    2、非严格语法,适合初学;
3、功能强大、跨平台;4、有巨大的第三方代码库CPAN
【报名费用】  注册费:2800元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
【付费方式】现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937 
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里备注上:“生物计算事业部培训费——您的姓名”)
【报名优惠政策】
1、    开课前20天报名的学员每人可减少200元(10.2以前);
开课前10天报名的学员每人可减少100元(10.12-10.2);
   2、 3人以上团体报名的学员每人可减少200元;
   3、 任意两班同时报名可减少300元(需一次性缴费);
   4、 4+1团报,可免费赠送一个名额                
   5、 上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
   6、 老学员、老学员介绍的学员均可以再优惠100元。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
【注意事项】
1、 已经成功付款的学员,如在开课前7个工作日前联系主办方撤销席位,可退还100%的注册费用;如在开课前3个工作日内(含3个工作日)要求撤销席位则退还80%的注册费用。
2、 撤销席位后,学员可提交延期申请,可参加当前时间到2013.12.12日期间由北京市计算中心举办的各类培训,费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款,退款期间产生的所有费用由学员本人承担
【请联系】张利英  010-59341771 ,18618295767,QQ号:2814500767,邮箱:zhangly@bcc.ac.cn
员丽丽   010-59341773, 18701529461 ,  邮箱:yuanll@bcc.ac.cn
报名回执表:
 
培训班类型:(可多选)
□实用生物信息学培训班  □论文发表所需的图表处理实用技能
□生物信息与宏基因组分析专题研讨班  □Perl语言专题班
姓名:
 
性别
 
民族:
 
职称:
 
身份证号
 
工作单位:
 
住宿:
是□;否□
研究方向:
 
报名时间:
 
通讯地址:
 
邮编:
 
固定电话:
 
手机:
 
E-mail:
 
报名种类:
A□           B□             (该选项仅报名生物信息培训班人员填写)
对课程了解情况
☆☆☆☆☆
感兴趣的课程:
 
信息渠道:
□中心主页 □邮件宣传(张利英、员丽丽)□海报 □单页 □销售员  □丁香园  □生物论坛  □生物通邮件、主页   □朋友推荐  □老学员推荐(  姓名  )
□是否有优惠卷
发票抬头:
 
发票内容:
 
住宿明细
入住时间:
离店时间:
房间类型
□大床间
□标准间(和       合住)
□拼房(与其他学员拼标准间)
备注:
 
确定报名后,请将回执表发到上述联系人邮箱里。如在两日内没有收到回复,请电话联系确认。如对课程有特殊需求的,请将需求发到上述联系人邮箱。
 


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