454(GS FLX系统)超高通量测序

    罗氏 公司的454 测序技术为广大用户提供了强大的下一代测序方法，为目前遗传分析和功能基因组等热门研究领域的部分热门课题提出了全新的应用方案。我公司与美国Creative Dynamics Inc公司协作开展454测序技术服务。

• 重测序项目

  随着测定基因组物种的增多，重测序成本越来越低，我们必将迎来一个重测序的时代。新一代DNA测序技术454大大降低了基因组重测序的成本，同时极大提高了测序效率。重测序1亿个碱基的费用为17万人民币，时间为3周。

• De Novo Sequencing 服务介绍

  获得一个物种的全基因组序列是加快对此物种了解的重要捷径。随着新一代测序技术的飞速发展，大规模基因组测序渐入佳境，基因组学研究也迎来新的发展契机和革命性突破。454技术以平均序列读长270bp遥遥领先于同系列高通量测序仪，而序列平均读长在基因组测序拼接过程中至关重要。该技术的突破将引发新的基因组测序热潮，为搭建种质基因组学平台和推动基因组学研究带来新的动力。

  基因组大小	草图报价	草图耗时	完成图报价	完成图耗时
  1M±0.5M	7万	3周	7万	3月
  3M±0.5M	13万	3周	13万	3～5月
  6M±1M	13万	3周	15万	4～7月

   

• 基本信息分析：图像识别，basecalling，过滤接头序列，检测可能的样品污染。

收费：此项服务免费

• 高级信息分析
  • 基因组注释：包括基因组组分分析、基因预测、重复序列注释、Non-coding RNA预 测和假基因（Pseudogene）注释等。收费：1万元人民币
  • 基因的功能注释及分类: 通过比对软件（Blast系列软件包）与公共数据中序列做同源性联配，在保证严格置信度标准前提下，对基因进行功能注释。最全面数据库的使用，保证所得数据与国际同步，最大限度挖掘基因组信息。

  收费：1.2万元人民币

  • 比较基因组及分子进化分析 序列同源比对、通过相邻物种的比较基因组研究进行进化分析、基因注释、功能分类等

  1) 共线性分析（Synteny）

  2) 基因家族聚类（Gene Family Clustering）

  3) 同源性分析（Orthology）

  4) 分子进化分析（Molecular Evolution）

  收费：1.2万元人民