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免费在线系列讲座-CADD在小分子药物研发中的应用
点击次数:1641 发布日期:2020-3-27  来源:本站 本站原创,转载请注明出处
近几十年来,随着计算机科学技术的发展,计算机辅助药物设计(CADD)已成为新药研究的重要手段之一,通过计算机辅助手段,可以有效地加速先导化合物的发现和优化,缩短药物研究与开发的周期,有效地降低开发成本。康昱盛是专为生命科学领域以及研发机构提供信息学产品及支持,在计算机辅助药物设计领域有出色的产品以及解决方案的公司。在疫情特殊时期,为了让广大对CADD感兴趣的药物研发科研工作者能便捷地了解、学习CADD技术在小分子药物研发中的应用,康昱盛将在2020年4月-5月举办四期免费的在线系列讲座。
 
主办单位:

上海康昱盛信息科技有限公司


主讲人:

林伟昱,产品经理
盛亚运,高级应用工程师
肖新哲,应用工程师

时间:

2020年4月2日(周四)15:00-16:00;
2020年4月16日(周四)15:00-16:00;
2020年4月30日(周四)15:00-16:00;
2020年5月14日(周四)15:00-16:00

授课方式:

免费网络授课

课程安排:                          

第一讲:In Silico Fragment-Based Drug Design: Approaches and Applications

2020年4月2日(周四)15:00-16:00

基于片段的药物设计是一种发现高质量候选药物的关键方法。作为对生物物理学的FBDD方法的补充,计算机模拟的FBDD采用基于结构的方法快速设计和筛选大的虚拟化合物库,考虑了更大化学空间的探索。

本次讲座将主要介绍基本的计算机模拟FBDD方法,涵盖了从组合片段库设计,到受体活性口袋的骨架跃迁、片段连接和生长。同时我们还将展示在MOE中如何通过基于反应的组合库设计和药化转化规则生成一系列相关联的衍生物,以及讨论如何利用药效团模型和2D/3D描述符来指导计算机模拟的FBDD过程。



 
第二讲:StarDrop BIOSTER:Automatic Compound Generation with Improved Properties

2020年4月16日(周四)15:00-16:00

       小分子药物设计、优化和数据分析平台StarDrop可以为用户带来极佳的交互式分子设计体验,利用StarDrop的分子设计模块Nova和化学经验知识库BIOSTER,用户可以基于多种方法全自动生成性质更佳的候选分子,并兼顾候选分子的可合成性。

       本次讲座将主要介绍利用StarDrop来进行药物分子de novo设计的方法,涵盖化合物创意转化功能、匹配系列分析以及虚拟库枚举,并利用StarDrop特有的多参数评价方法和强大的交互式设计功能,来指导如何通过StarDrop全自动生成性质更均衡、更具化学创意的候选化合物。


 
第三讲:StarDrop P450 Foreseeing Molecules: Additional P450 Prediction Guiding in silico Drug Design

2020年4月30日(周四)15:00-16:00

       作为全球领先的药物代谢预测软件,StarDrop的代谢预测模块P450广受全球用户的青睐。现今,P450模块即将在原来针对七种主要细胞色素P450酶亚型基础上增加更多预测模型,包含黄素单加氧酶(FMO)和尿苷二磷酸葡萄糖醛酸糖基转移酶(UGT)预测模型。

       本次讲座将为您展示利用StarDrop的P450模块进行药物代谢预测及候选分子改造的功能,并展示全新的FMO和UGT预测模型。联合顶尖的毒性预测模块Derek Nexus,帮助您在模拟阶段既可评估药物分子及代谢产物的各项ADME性质及毒性,帮助您获得性质更优、毒性更小的候选分子。


第四讲:Small Molecule Virtual Screening

2020年5月14日(周四)15:00-16:00

虚拟筛选 (Virtual Screening, VS) 是基于小分子数据库开展的活性化合物筛选。利用小分子化合物与药物靶标间的分子对接运算,虚拟筛选可快速从几十至上百万分子中,遴选出具有成药性的活性化合物,大大降低实验筛选化合物数量,缩短研究周期,降低药物研发的成本。据报道虚拟筛选的阳性率为5%-30%,利用虚拟筛选成功辅助药物设计的案例逐年增多,虚拟筛选已成为目前最有潜力的药物开发工具。

本次讲座将系统介绍虚拟筛选的基本原理和一般流程,并以2019新冠病毒3CL水解酶晶体结构(PDB code:6LU7)为例,通过MOE的多个模块演示带大家快速地深入了解和熟悉虚筛的具体操作。


如何报名:

如果您计划参加,可以通过以下四种方式报名,为保证讲课质量,报名人数有限,建议您提前报名!

1. 进入康昱盛官方网站 http://www.cloudscientific.com/plus/view.php?aid=380,进入活动页面,点击左下角“我要报名sign up"。
2. 将 “CADD+姓名+单位+邮箱+电话+研究方向”发送到marketing@cloudscientific.com,即可。
3. 关注“康昱盛”公众号,发送CADD+姓名+单位+邮箱+电话+研究方向”到公众号报名。


 
4. 直接通过电话报名,电话: 021- 54975000

备注:您提交报名信息后,我们会在一个工作日内通过电话或者微信联系您,并在网络讲座开始当日为您提供网络授课地址,您可以与您的同学或同事共享学习!
 
 
关于MOE (Molecular Operating Environment)

MOE是由加拿大CCG公司开发的功能全面、强大的分子模拟及药物设计综合软件,它是目前市场上最被广泛应用的一个软件包,世界排名前50的生物医药研发公司都在用这套软件系统;在科研领域每年引用这个软件发表的高水平文章多达近千篇。MOE集可视化、模拟和应用开发于一体,可以轻松、灵活地用于基于结构和基于片段的药物设计,药效团的发现和筛选,药物化学的应用,生物药的应用,蛋白和抗体的建模,分子建模和模拟,化学信息学和定量构效关系,以及定制化开发等等。

关于StarDrop

StarDrop是一个用于在药物发现中辅助决策、帮助项目组快速确定高质量化合物的软件。
StarDrop用于评估复杂的数据,这些数据通常由于实验或预测产生的误差而具有一定的不确定性。在对数据进行评分时,StarDrop给您带来可靠与直观简洁的方法,以帮助做出决策:哪些化合物是您需要优先考虑开发的。StarDrop良好的交互式工具可以帮助您有效地开拓改进化合物的途径。通过其高度可视化、易于使用的界面,StarDrop将指导您完成每个阶段的化合物选择和设计过程。StarDrop独特的Card View为您提供了自由的环境去探索、管理您的项目数据,根据您自己的想法获取化合物之间的关系;不再受限于表格和列表,从而能快速地找到高质量的化合物和新的优化策略。
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相关公司:上海康昱盛信息科技有限公司
联系电话:021-54975000
E-mail:marketing@cloudscientific.com


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